文献

J-GLOBAL ID：201702256786557667   整理番号：17A1248429

保存されたコアトリプトファン残基による阻害剤のKunitz(STI)ファミリーにおける安定性の分子的基礎の理解:理論的研究【Powered by NICT】

Understanding the molecular basis of stability in Kunitz (STI) family of inhibitors in terms of a conserved core tryptophan residue: A theoretical investigation

著者 (5件)： Datta Sharma Ravi (Amity Institute of Biotechnology (AIB), Amity University Haryana, India) ,  Datta Sharma Ravi (Amity Institute of Intgerative Sciences and Health (AIISH), Amity University Haryana, NH-8, Panchgaon, Gurgaon, 122413, India) ,  Goswami Nabajyoti (Bioinformatics Infrastructure Facility (BIF), College of Veterinary Science, Assam Agricultural University, Khanapara, Guwahati, 781022, India) ,  Ghosh Debasree (Amity Institute of Nanotechnology, Amity University Haryana, India) ,  Majumder Sudip (Department of Chemistry, Amity School of Applied Sciences, Amity University Haryana, India)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 75  ページ： 233-240  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： β-トレフォイル蛋白質間の超折畳みの一つである。阻害剤のインターロイキン(IL),FibroblastGrowth因子(FGF),Kunitz(STI)ファミリーのような蛋白質の重要なクラスはこの折畳みに属している。蛋白質阻害剤のKunitz(STI)ファミリーは高度に保存され,構造的に重要なTrytophan91(W91)残基,蓋とバレルのトップ層を縫合を有していた。本論文では,Kunitz(STI)ファミリーの安定性と折畳み経路におけるこのW91残基の関与の分子的洞察を調べた。シカクマメキモトリプシン阻害剤(WCI),Kunitz(STI)ファミリーのメンバーは,作業を行うためのモデル系として選んだ。分子動力学(MD)シミュレーションは,全六蛋白質のセット,野生型WCI(WT)と五変異体すなわちW91F,W91M,W91A,W91HとW91Iなどで行った。それらの全ての中で四--蛋白質の座標は蛋白質データバンク(PDB)に蓄積されてそれらの結晶構造から採取した,in silicoモデリングを用いた残りの二の座標を生成した。著者らの結果は,本当にこのW91残基は,Kunitz(STI)ファミリーの安定性と折畳み経路における決定的な役割を果たすことを示唆する。変異体はより安定性は低く,野生型WCIと比較して,より高い温度でより速い変性を受けやすかった。これらの効果は,最小変異体すなわちW91HとW91Aで最も顕著であり,それ以上の蛋白質が不安定になるがW91部位の突然変異によって作られた空洞であることを示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *折畳み ,  モデリング ,  野生型 ,  モデル ,  突然変異 ,  分子動力学 ,  タンパク質 ,  結晶構造 ,  キモトリプシン阻害剤
準シソーラス用語： in silico ,  蛋白質データベース ,  シカクマメ ,  *残基 ,  *阻害剤 ,  *トリプトファン残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： シカクマメキモトリプシン阻害剤(WCI) ,  β-トレフォイル折畳み ,  分子動力学(MD)シミュレーション ,  コア残基 ,  蛋白質安定性

分類 (3件)： 分子化合物  (CE02000C) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W)

タイトルに関連する用語 (12件)： 保存 ,  コア ,  トリプトファン残基 ,  阻害剤 ,  STI ,  ファミリー ,  安定性 ,  分子 ,  基礎 ,  理解 ,  理論 ,  研究