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J-GLOBAL ID：201702256908741029   整理番号：17A1744082

類似性分析と歴史的トレーサビリティの分類についての研究は,類似性があることを示している。【JST・京大機械翻訳】

Homology analysis and historical tracing for inter-continental Burkholderia pseudomallei strains of sequence type 562

著者 (8件)： Zheng Xiao (中国疾病預防控制中心伝染病預防控制所伝染病預防控制国家重点実験室,北京,102206) ,  Wang Luqian (102200,北京市昌平区疾病預防控制中心応急弁公室) ,  Wu Hua (海南省人民医院検験科,海口,570311) ,  Chen Hai (572000,三亜市人民医院検験科) ,  Zhu Xiong (572000,三亜市人民医院検験科) ,  He Jinrong (中国疾病預防控制中心伝染病預防控制所伝染病預防控制国家重点実験室,北京,102206) ,  Xia Lianxu (中国疾病預防控制中心伝染病預防控制所伝染病預防控制国家重点実験室,北京,102206) ,  Li Wei (中国疾病預防控制中心伝染病預防控制所伝染病預防控制国家重点実験室,北京,102206)
資料名： Zhonghua Liuxingbingxue Zazhi  (Zhonghua Liuxingbingxue Zazhi)
巻： 38  号： 5  ページ： 661-664  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2330A  ISSN： 0254-6450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:異なる年代により、オーストラリア、中国海南地区の7株のST562型の鼻内Burkholderia fumigatus菌の類似性を比較し、その伝播源を分析する。【方法】生物学的情報法を用いて,MSHR5858と中国の海南省の歴史的菌株350105におけるSpe I制限酵素断片のフィンガープリントと多変量可変配列反復配列多型(MLVA-4)の遺伝的特徴を検出した。また、近年分離された5株の海南型ST562型臨床株のパルスフィールドゲル電気泳動(PFGE、Spe I酵素)、MLVA-4分子タイピング結果と比較した。同時に、MSHR5858と350105のゲノムレベルにおける共線性と相同性を分析した。【結果】5つの株の間には,類似の類似性があった(類似性>97%),そして,それはオーストラリアの臨床株MSHR5858のSpe I制限型バンドと一致していた。オーストラリアの臨床株(MSHR5858)と海南省の歴史的菌株(350105)のゲノムにおけるSpe I制限断片の数はそれぞれ31と34であり、そのうち31個の断片の長さは一致しており、5株の海南ST562の臨床株のMLVA-4型はそれぞれ異なっていた。しかし、HPPH43(MLVA-4フィンガープリント:10、8、10、8)はMSHR5858(10、8、8、6)と2341 k、1788 kの二つの遺伝子座の重複数が同じであった。その結果,HK003(11,8,15,7),HK061(11,8,17,7)と歴史的菌株(350105(11,8,11,8))の間の重複点は同じであることが示された。さらに、350105とMSHR5858はゲノムレベルで良好な共線性を有し、共有遺伝子は大部分を占め、起源が一致していることが示唆された。結論:分離された7株のST562型は、中国海南の臨床分離株、歴史株及びオーストラリア臨床分離株を含む遺伝的特徴が一致し、しかもST562型の近年流行株は歴史株350105と同源関係がある。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 臨床分離菌 ,  *相似解 ,  パルスフィールドゲル電気泳動 ,  *類似性 ,  相同性 ,  DNA制限酵素 ,  指紋 ,  遺伝 ,  オーストラリア連邦 ,  中華人民共和国 ,  ゲノム
準シソーラス用語： 分子タイピング ,  MLVA法 ,  菌株 ,  海南省 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Burkholderia pseudomallei ,  Inter-continental epidemic ,  Homology analysis

分類 (2件)： 生薬一般  (GX06010Y) ,  有機化合物のクロマトグラフィー,電気泳動分析  (CC04034H)

タイトルに関連する用語 (6件)： 類似性分析 ,  歴史 ,  トレーサビリティ ,  分類 ,  研究 ,  類似性