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J-GLOBAL ID：201702257399502877   整理番号：17A1075240

ソラマメ(Vicia faba L.)のゲノム資源の強化

Enhancing faba bean (Vicia faba L.) genome resources

著者 (8件)： COOPER James W. (Univ. Leeds, Leeds, GBR) ,  WILSON Michael H. (Univ. Leeds, Leeds, GBR) ,  DERKS Martijn F. L. (Univ. Leeds, Leeds, GBR) ,  DERKS Martijn F. L. (Wageningen Univ., Wageningen, NLD) ,  SMIT Sandra (Wageningen Univ., Wageningen, NLD) ,  KUNERT Karl J. (Univ. Pretoria, Pretoria, ZAF) ,  CULLIS Christopher (Case Western Reserve Univ., OH, USA) ,  FOYER Christine H. (Univ. Leeds, Leeds, GBR)
資料名： Journal of Experimental Botany  (Journal of Experimental Botany)
巻： 68  号： 8  ページ： 1941-1953  発行年： 2017年04月 
JST資料番号： C0579A  ISSN： 0022-0957  CODEN： JEBOA6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ソラマメなどのマメ科植物では,ゲノム資源の不足が育種の足かせになっている。筆者らは,その問題を解決するために,ソラマメ(Vicia faba)のRNA-seq解析を行った。ソラマメの参照トランスクリプトームに対するリードアラインメントによって,16300の高質単一遺伝子群を同定した。Illuminaペアードエンドシークエンシングを用いて,ゲノム情報アセンブリの基盤を確立した。その結果,配列の85%以上は既知の遺伝子と一致しなかった。参照トランスクリプトーム単一遺伝子群の26000以上はDNA-seqリードと一致した。配列長データは,DNA-seqコンティグの全長への一致によって461の推定遺伝子座に展開した。種間と種内のオルガネラゲノムの比較によって,主要なマメ科のオルガネラの遺伝子セットを確立し,ソラマメのオルガネラゲノムの多型領域が明らかになった。

シソーラス用語： *ソラマメ ,  *ゲノム ,  作物育種 ,  遺伝学実験技術 ,  トランスクリプトーム ,  遺伝情報 ,  オルガネラ ,  遺伝子 ,  マメ科
準シソーラス用語： Illuminaシークエンシング ,  RNA-seq ,  ゲノム情報 ,  プラストーム ,  ミトコンドリアゲノム

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  豆類  (FC03035U)

タイトルに関連する用語 (6件)： ソラマメ ,  Vicia ,  FABA ,  ゲノム ,  資源 ,  強化