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J-GLOBAL ID：201702258192530530   整理番号：17A0172510

1例の上気道感染症例のハイスループット配列決定病原同定【JST・京大機械翻訳】

Identifying the pathogens of one patient with upper respiratory infection using high throughput sequencing technology

著者 (10件)： Guo Xiling (Key Laboratories of Enteric Pathogenic Microbiology ( Ministry of Health ), Institute of Pathogenic Microbiology, Jiangsu Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Ge Yiyue (Key Laboratories of Enteric Pathogenic Microbiology ( Ministry of Health ), Institute of Pathogenic Microbiology, Jiangsu Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Zhao Kangchen (Key Laboratories of Enteric Pathogenic Microbiology ( Ministry of Health ), Institute of Pathogenic Microbiology, Jiangsu Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Zhu Xiaojuan (Key Laboratories of Enteric Pathogenic Microbiology ( Ministry of Health ), Institute of Pathogenic Microbiology, Jiangsu Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Qi Xian (Key Laboratories of Enteric Pathogenic Microbiology ( Ministry of Health ), Institute of Pathogenic Microbiology, Jiangsu Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Chen Yin (Key Laboratories of Enteric Pathogenic Microbiology ( Ministry of Health ), Institute of Pathogenic Microbiology, Jiangsu Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Shi Zhiyang (Key Laboratories of Enteric Pathogenic Microbiology ( Ministry of Health ), Institute of Pathogenic Microbiology, Jiangsu Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Zhu Fengcai (Key Laboratories of Enteric Pathogenic Microbiology ( Ministry of Health ), Institute of Pathogenic Microbiology, Jiangsu Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Zhou Minghao (Key Laboratories of Enteric Pathogenic Microbiology ( Ministry of Health ), Institute of Pathogenic Microbiology, Jiangsu Provincial Center for Disease Control and Prevention) ,  Cui Lunbiao (Key Laboratories of Enteric Pathogenic Microbiology ( Ministry of Health ), Institute of Pathogenic Microbiology, Jiangsu Provincial Center for Disease Control and Prevention)
資料名： Zhonghua Shiyan he Linchuang Bingduxue Zazhi  (Zhonghua Shiyan he Linchuang Bingduxue Zazhi)
巻： 30  号： 5  ページ： 421-424  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2338A  ISSN： 1003-9279  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:ハイスループット配列決定技術を用いて、1例の上気道感染症例の病原性を同定し、サンプル前処理方法を最適化する。【方法】咽頭スワブサンプルを,ヌクレアーゼと/またはリボソームRNAプローブによって前処理した。非配列依存性単一プライマー増幅(SEQUENCE-INDEPENDENT SINGLE PRIMER AMPLIFICATION,SISPA)後に配列決定ライブラリーを作製し、MISEQハイスループットシークエンシングを利用した。配列解析の結果は,生物情報分析とREAL TIME RT-PCRによって検証した。【結果】配列解析の結果,B型はウイルス配列データベースと比較して,インフルエンザウイルスの配列が存在することが示され,そして,配列解析により,ヌクレアーゼは,高配列の数と被覆率を増加させることができた。結論:ヌクレアーゼと/またはリボソームRNAプローブハイブリダイゼーション処理サンプルを結合したハイスループット配列決定技術は,迅速かつ効率的に病原性感染の病原体を検出することができる。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ウイルス ,  咽頭 ,  病原性 ,  データベース ,  ヌクレアーゼ ,  *感染 ,  前処理 ,  インフルエンザウイルス ,  リボソーム ,  RT-PCR法 ,  最適化 ,  被覆率
準シソーラス用語： 配列解析 ,  RNAプローブ ,  *ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Influenza B virus ,  high throughput sequencing ,  nuclease ,  ribosomal RNA

分類 (2件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (4件)： 上気道感染 ,  症例 ,  ハイスループット ,  同定