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J-GLOBAL ID：201702258401197567   整理番号：17A1215227

触媒的に有能なニトロレダクターゼの機構インフォームド精密化は変化した基質結合モード【Powered by NICT】

Mechanism-Informed Refinement Reveals Altered Substrate-Binding Mode for Catalytically Competent Nitroreductase

著者 (6件)： Pitsawong Warintra (Department of Chemistry, University of Kentucky, 505 Rose Street, Lexington, KY 40506-0055, USA) ,  Haynes Chad A. (Department of Molecular and Cellular Biochemistry and Center for Structural Biology, University of Kentucky, 741 South Limestone Street, Lexington, KY 40536-0509, USA) ,  Koder Ronald L. (Department of Chemistry, University of Kentucky, 505 Rose Street, Lexington, KY 40506-0055, USA) ,  Rodgers David W. (Department of Molecular and Cellular Biochemistry and Center for Structural Biology, University of Kentucky, 741 South Limestone Street, Lexington, KY 40536-0509, USA) ,  Miller Anne-Frances (Department of Chemistry, University of Kentucky, 505 Rose Street, Lexington, KY 40506-0055, USA) ,  Miller Anne-Frances (Department of Molecular and Cellular Biochemistry and Center for Structural Biology, University of Kentucky, 741 South Limestone Street, Lexington, KY 40536-0509, USA)
資料名： Structure  (Structure)
巻： 25  号： 7  ページ： 978-987.e4  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1212A  ISSN： 0969-2126  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Enterobacter cloacaeのニトロレダクターゼ(NR)を,除草剤や火薬,とプロドラッグを含む多様な芳香族ニトロ化合物を減少させ,バイオレメディエーション,プロドラッグ活性化,および酵素支援合成に有望である。その二半反応の各々に対して結合した基質または類似体とNR複合体の結晶構造を解析した。は速度論的同位体効果(KIE)測定各半反応に必須であるH-移動段階を解明を補完した。KIEsはNADH類似体ニコチン酸アデニンジヌクレオチド(NAAD)とNRの構造と一致するフラビンへのNADHからのヒドリド移動を示した。p-ニトロ安息香酸(p NBA)の還元に及ぼすKIEもヒドリド移動を示し,前計算機構の修正を必要とした。著者らの機構的情報は結合基質の配向の構造的拘束を提供し,ニトロ基を置くNADHのアミドに結合するポケットにおけるフラビンN5に近かった。KIEsは溶媒はプロトンを提供し,異なったニトロ基配置の適応,NRの広いレパートリーと一致を可能にすることを示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 複合体 ,  バイオレメディエーション ,  *基質 ,  同位体効果 ,  結晶構造 ,  *触媒 ,  ヒドリド移動 ,  プロドラッグ ,  *窒素オキシドレダクターゼ ,  ニトロ基 ,  類似物質 ,  Enterobacter cloacae ,  芳香族ニトロ化合物 ,  アデニンヌクレオチド ,  ニコチンアミドヌクレオチド ,  ジヌクレオチド
準シソーラス用語： フラビン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： ニトロレダクターゼ ,  flavoenzyme ,  構造 ,  プロドラッグ活性化 ,  修復 ,  同位体効果 ,  基質結合モード

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (1件)： NADH

タイトルに関連する用語 (5件)： 触媒 ,  ニトロレダクターゼ ,  精密化 ,  基質 ,  結合モード