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J-GLOBAL ID：201702258501175196   整理番号：17A1825993

環境DNA metabarcoding:我々は動物と植物群落の調査方法変換【Powered by NICT】

Environmental DNA metabarcoding: Transforming how we survey animal and plant communities

著者 (16件)： Deiner Kristy (Atkinson Center for a Sustainable Future, Department of Ecology and Evolutionary Biology, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Bik Holly M. (Department of Nematology, University of California, Riverside, CA, USA) ,  Maechler Elvira (Eawag, Swiss Federal Institute of Aquatic Science and Technology, Department of Aquatic Ecology, Duebendorf, Switzerland) ,  Maechler Elvira (Department of Evolutionary Biology and Environmental Studies, University of Zurich, Zuerich, Switzerland) ,  Seymour Mathew (Molecular Ecology and Fisheries Genetics Laboratory, School of Biological Sciences, Environment Centre Wales Building, Bangor University, Bangor, Gwynedd, UK) ,  Lacoursiere-Roussel Anaies (IBIS (Institut de Biologie Integrative et des Systemes), Universite Laval, Quebec, QC, Canada) ,  Altermatt Florian (Eawag, Swiss Federal Institute of Aquatic Science and Technology, Department of Aquatic Ecology, Duebendorf, Switzerland) ,  Altermatt Florian (Department of Evolutionary Biology and Environmental Studies, University of Zurich, Zuerich, Switzerland) ,  Creer Simon (Molecular Ecology and Fisheries Genetics Laboratory, School of Biological Sciences, Environment Centre Wales Building, Bangor University, Bangor, Gwynedd, UK) ,  Bista Iliana (Molecular Ecology and Fisheries Genetics Laboratory, School of Biological Sciences, Environment Centre Wales Building, Bangor University, Bangor, Gwynedd, UK) ,  Bista Iliana (Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, UK) ,  Lodge David M. (Atkinson Center for a Sustainable Future, Department of Ecology and Evolutionary Biology, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  de Vere Natasha (Conservation and Research Department, National Botanic Garden of Wales, Llanarthne, Carmarthenshire, UK) ,  de Vere Natasha (Institute of Biological, Environmental and Rural Sciences, Aberystwyth University, Aberystwyth, UK) ,  Pfrender Michael E. (Department of Biological Sciences and Environmental Change Initiative, University of Notre Dame, Notre Dame, IN, USA) ,  Bernatchez Louis (IBIS (Institut de Biologie Integrative et des Systemes), Universite Laval, Quebec, QC, Canada)
資料名： Molecular Ecology  (Molecular Ecology)
巻： 26  号： 21  ページ： 5872-5895  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2684A  ISSN： 0962-1083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノム革命は基本的には地球上の生物多様性をどのように変化してきた。ハイスループット配列決定(”HTS”)プラットフォームは,多様な種類の環境試料(「環境DNA」または「eDNA」と呼ばれる)からのDNAの迅速配列決定を可能にした。分類名のeDNAからの関連配列する我々の能力をもつHTS結合は「eDNA metabarcoding」と呼ばれ,多くの生態系からの調査種豊度非侵襲的できる強力な分子ツールを提供した。,動物と植物の豊かさを調査するためのeDNA metabarcodingの使用,および相対的な豊度を推定するためのeDNAアプローチを用いて課題をレビューした。淡水,海洋および地上環境におけるeDNA応用を強調し,この広い文脈において,空間および時間を越えた豊度を近似するために何が異なるeDNA試料タイプの能力についてはほとんど知られて抽出。研究設計のための誘導質問を提供し,プライマーとライブラリー調製方法に焦点を当てたeDNA metabarcodingワークフローを検討した。追加データセットの生物情報学的フィルタリングを考慮するための重要な基準を考察し,透明性増加のための勧告。最後に,将来を見据えて,著者らは,生態学,保存,侵入生物学,バイオモニタリング,eDNA metabarcoding市民科学と生物多様性教育を強化できるかでeDNA metabarcodingの新たな応用を考察した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： ゲノム ,  生態学 ,  フィルタリング ,  *DNA【核酸】 ,  *動物 ,  生態系 ,  海洋 ,  生物多様性 ,  淡水 ,  *植物群落 ,  環境試料
準シソーラス用語： バイオモニタリング ,  侵入種 ,  バイオインフォマティクス ,  *環境DNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： バイオインフォマティクスパイプライン ,  バイオモニタリング ,  市民科学 ,  保存 ,  生態学 ,  eDNA ,  侵入種 ,  マクロ生物 ,  種の豊富さ

分類 (2件)： 植物生態学  (EE02000E) ,  異種生物間相互作用  (EE01050A)

タイトルに関連する用語 (4件)： 環境DNA ,  動物 ,  植物群落 ,  調査