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J-GLOBAL ID：201702258753867696   整理番号：17A1984306

トランスクリプトーム配列に基づくカザフヒツジ感染症後の小腸組織における新たな転写予測と分析【JST・京大機械翻訳】

Prediction and analysis of novel transcripts based on RNA-seq of Kazakh Sheep infected by Echinococcosis

著者 (8件)： Li Xin (石河子大学生命科学学院,新疆石河子,832003) ,  Jia Lijia (石河子大学生命科学学院,新疆石河子,832003) ,  Xu Lulu (石河子大学生命科学学院,新疆石河子,832003) ,  Wang Yue (石河子大学生命科学学院,新疆石河子,832003) ,  Jiang Song (石河子大学動物科技学院,新疆石河子,832003) ,  Wang Kaisheng (石河子大学動物科技学院,新疆石河子,832003) ,  Xi Jifeng (石河子大学動物科技学院,新疆石河子,832003) ,  Jia Bin (石河子大学動物科技学院,新疆石河子,832003)
資料名： Shihezi Daxue Xuebao (Ziran Kexue Ban)  (Shihezi Daxue Xuebao (Ziran Kexue Ban))
巻： 35  号： 3  ページ： 326-333  発行年： 2017年 
JST資料番号： C3206A  ISSN： 1007-7383  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 以前の研究によると、MHC-DRB1遺伝子のハプロタイプMva I bc-SacIIA-Hinl Iabを持つカザフヒツジは包虫病に対して強い抵抗性を持つが、具体的なメカニズムはまだ不明である。本研究では、可変せん断によって形成された小腸組織の新たな転写と密接な関係があると推測されるため、本研究では、PCR-RFLP法を用いて、290匹のカザフヒツジから耐病性と非耐病性個体を選択し、耐性群(Aタル)、非耐性群(B群)と空白対照群(C群)に分けた。A組とB組の人工感染包虫病の一定時間後に、C組と同時に屠殺し、それぞれ小腸組織を取り、Illumina転写組のシークエンシングを行い、蛍光リアルタイム定量実験により検証した後、生物情報学方法を用いて各組の新転写物に対して予測と分析を行った。結果は以下を示した。qRT-PCRによる検証結果により、転写配列の配列決定結果の信頼性が高く、生物情報学方法により、それぞれA、BとC組のサンプルから1393、1260、1097個を予測し、計3750個の転写転写物があることが明らかになった。転写物のエキソン数と生物学的機能の多様性には密接な関係があり、研究により、3つのサンプルの中に2つ以上のエクソンを含む新しい転写が34.64%(1299個)を占めることが分かった。研究の結果,カザフ感染後の小腸組織における新しい転写は有意に増加し,C群と比較してA群とB群において,それぞれ26.98%と14.86%増加したことが示された(P<0.05)。新しい転写物によって誘導される差別的発現遺伝子は,自然毒性細胞によって媒介される細胞毒性経路,シトクロムC-P450によって媒介される外因性化学物質代謝経路,およびレチノール代謝経路などの代謝経路に蓄積される。結論;研究により、カザフヒツジが包虫症に感染した後、異なるMHC-DB1遺伝子型個体の小腸組織中に大量の新規転写物が存在し、個体の耐病性との関連性があることが分かった。本研究は,カザフヒツジの分子抵抗性機構と遺伝的育種マーカーの研究のための新しいアイデアと理論的基礎を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *感染 ,  化学物質 ,  *カザフスタン共和国 ,  *小腸 ,  遺伝子型 ,  遺伝子 ,  代謝経路 ,  *トランスクリプトーム ,  耐病性 ,  *予測 ,  遺伝 ,  生殖細胞 ,  細胞毒性
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  包虫嚢胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Kazakh Sheep ,  Cystic echinococcosis ,  small intestine tisssues ,  illumina RNA-seq ,  novel transcripts

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (9件)： トランスクリプトーム ,  カザフ ,  ヒツジ ,  感染症 ,  小腸 ,  組織 ,  転写 ,  予測 ,  分析