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J-GLOBAL ID：201702259365243754   整理番号：17A0891366

SNP相互作用パターン識別子(SIPI) SNP-SNP相互作用パターンに対する集中探索

SNP interaction pattern identifier (SIPI): an intensive search for SNP-SNP interaction patterns

著者 (51件)： LIN Hui-Yi (Louisiana State Univ. Health Sci. Center, LA, USA) ,  CHEN Dung-Tsa (Moffitt Cancer Center & Res. Inst., FL, USA) ,  HUANG Po-Yu (Industrial Technol. Res. Inst., Hsinchu City, TWN) ,  LIU Yung-Hsin (INC Res., LLC, NC, USA) ,  OCHOA Augusto (Louisiana State Univ. Health Sci. Center, LA, USA) ,  ZABALETA Jovanny (Louisiana State Univ. Health Sci. Center, LA, USA) ,  MERCANTE Donald E. (Louisiana State Univ. Health Sci. Center, LA, USA) ,  FANG Zhide (Louisiana State Univ. Health Sci. Center, LA, USA) ,  SELLERS Thomas A. (Moffitt Cancer Center & Res. Inst., FL, USA) ,  POW-SANG Julio M. (Moffitt Cancer Center & Res. Inst., FL, USA) ,  CHENG Chia-Ho (Moffitt Cancer Center & Res. Inst., FL, USA) ,  EELES Rosalind (Inst. of Cancer Res., London, GBR) ,  EELES Rosalind (Royal Marsden NHS Foundation Trust, London, GBR) ,  EASTON Doug (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  KOTE-JARAI Zsofia (Inst. of Cancer Res., London, GBR) ,  AL OLAMA Ali Amin (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  BENLLOCH Sara (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  MUIR Kenneth (Univ. Warwick, Coventry, GBR) ,  GILES Graham G. (Cancer Council Victoria, Victoria, AUS) ,  GILES Graham G. (Univ. Melbourne, Victoria, AUS) ,  WIKLUND Fredrik (Karolinska Inst., Stockholm, SWE) ,  GRONBERG Henrik (Karolinska Inst., Stockholm, SWE) ,  HAIMAN Christopher A. (Univ. Southern California/Norris Cormprehensive Cancer Center, CA, USA) ,  SCHLEUTKER Johanna (Univ. Turku, Turku, FIN) ,  SCHLEUTKER Johanna (Turku Univ. Hospital, Turku, FIN) ,  SCHLEUTKER Johanna (Univ. Tampere, Tampere, FIN) ,  NORDESTGAARD Borge G. (Copenhagen Univ. Hospital, Herlev, DNK) ,  TRAVIS Ruth C. (Nuffield Dep. of Population Health Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  HAMDY Freddie (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  PASHAYAN Nora (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  PASHAYAN Nora (Univ. Coll. London, London, GBR) ,  KHAW Kay-Tee (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  STANFORD Janet L. (Fred Hutchinson Cancer Res. Center, WA, USA) ,  STANFORD Janet L. (Univ. Washington, WA, USA) ,  BLOT William J. (International Epidemiology Inst., MD, USA) ,  THIBODEAU Stephen N. (Mayo Clinic, MN, USA) ,  MAIER Christiane (Inst. Human Genetics Univ. Hospital Ulm, Ulm, DEU) ,  KIBEL Adam S. (Brigham and Women’s Hospital/Dana-Farber Cancer Inst., MA, USA) ,  KIBEL Adam S. (Washington Univ., MO, USA) ,  CYBULSKI Cezary (Pomeranian Medical Univ., Szczecin, POL) ,  CANNON-ALBRIGHT Lisa (Univ. Utah School of Medicine, UT, USA) ,  BRENNER Hermann (German Cancer Res. Center (DKFZ), Heidelberg, DEU) ,  BRENNER Hermann (German Cancer Res. Center (DKFZ) and National Center for Tumor Diseases (NCT), Heidelberg, DEU) ,  BRENNER Hermann (German Cancer Consortium (DKTK) German Cancer Res. Center (DKFZ), Heidelberg, DEU) ,  KANEVA Radka (Medical Univ. Sofia, Sofia, BGR) ,  BATRA Jyotsna (Queensland Univ. of Technol., Brisbane, AUS) ,  TEIXEIRA Manuel R. (Portuguese Oncology Inst., Porto, PRT) ,  TEIXEIRA Manuel R. (Porto Univ., Porto, PRT) ,  PANDHA Hardev (Univ. Surrey, Surrey, GBR) ,  LU Yong-Jie (Queen Mary Univ. London, London, GBR) ,  PARK Jong Y. (Moffitt Cancer Center & Res. Inst., FL, USA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 6  ページ： 822-833  発行年： 2017年03月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 二元結果に対する相互作用パターンを試験するSNP相互作用パターン識別子(SIPI)を提案した。SIPIは,非階層モデル,インヘリタンスモードおよびモード符号化方向を考慮している。SIPIは,相互作用の検出においてMDR(多因子次元削減),AA_Full.Geo_Full(付加および遺伝子型モードを持つ完全相互作用モデル)およびSNPassocより高い計算力を持つことをシミュレーション結果が示した。

シソーラス用語： *一塩基多型 ,  *相互作用 ,  *パターン分類 ,  モデル ,  データベース ,  階層構造 ,  継承 ,  符号化 ,  検出 ,  遺伝学実験技術 ,  統計的方法 ,  アルゴリズム ,  遺伝子型 ,  シミュレーション
準シソーラス用語： *SNP ,  *パターン識別 ,  階層モデル ,  インヘリタンス ,  多因子次元削減

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  パターン認識  (JE07000S)

タイトルに関連する用語 (4件)： SNP ,  相互作用 ,  識別子 ,  探索