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J-GLOBAL ID：201702259848105284   整理番号：17A2008095

トマト(Solanum lycopersicum)における生物ストレス関連遺伝子の計算機解読【Powered by NICT】

Computational deciphering of biotic stress associated genes in tomato (Solanum lycopersicum)

著者 (9件)： Tandon G. (Centre for Agricultural Bioinformatics, ICAR-Indian Agricultural Statistics Research Institute, New Delhi 1100 12, India) ,  Tandon G. (Departments of Computational Biology & Bioinformatics, Jacob School of Biotechnology & Bio-Engineering, SHUATS, Allahabad 211007, India) ,  Singh S. (Departments of Computational Biology & Bioinformatics, Jacob School of Biotechnology & Bio-Engineering, SHUATS, Allahabad 211007, India) ,  Kaur S. (Centre for Agricultural Bioinformatics, ICAR-Indian Agricultural Statistics Research Institute, New Delhi 1100 12, India) ,  Kaur S. (Departments of Computational Biology & Bioinformatics, Jacob School of Biotechnology & Bio-Engineering, SHUATS, Allahabad 211007, India) ,  Sarika (Centre for Agricultural Bioinformatics, ICAR-Indian Agricultural Statistics Research Institute, New Delhi 1100 12, India) ,  Iquebal M.A. (Centre for Agricultural Bioinformatics, ICAR-Indian Agricultural Statistics Research Institute, New Delhi 1100 12, India) ,  Rai A. (Centre for Agricultural Bioinformatics, ICAR-Indian Agricultural Statistics Research Institute, New Delhi 1100 12, India) ,  Kumar D. (Centre for Agricultural Bioinformatics, ICAR-Indian Agricultural Statistics Research Institute, New Delhi 1100 12, India)
資料名： Genomics Data  (Genomics Data)
巻： 14  ページ： 82-90  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2966A  ISSN： 2213-5960  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： トマト(Solanum lycopersicum)は主要な野菜植物の一つであり,果実の発育のモデル系である。その世界的に重要であるそのリコペン色素抗酸化性や抗癌性があるによるものであった。>1.5Mがトマトの生物的ストレス関連EST(発現配列タグ)が利用可能であるが,遺伝子を予測するための累積解析が必要である。全ゲノムde novo集合の有用性は異なる染色体上でそれらを地図化するのに使える。さらに,利用可能な0.14M目録マーカーは,品種改良プログラムでの特異的望ましい遺伝子を移入するため用いることができる。ここでは,トマトの生物ストレスに関連する57種の新規遺伝子と共に異なる染色体上の物理的位置を持つ50の遺伝子を報告した。もこれらの生物的ストレス関連遺伝子の調節に関与する52シス調節エレメント及び69の推定miRNAを報告した。生物ストレスに関連するこれらの推定候補遺伝子はトマト生産性とその持続可能な生殖質管理の努力における分子育種に用いることができる。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： ゲノム ,  育種 ,  染色体 ,  *遺伝子 ,  色素 ,  *トマト ,  抗腫瘍作用 ,  カロチノイド ,  脂肪族炭化水素 ,  不飽和炭化水素 ,  共役ジエン
準シソーラス用語： 分子育種 ,  生殖質 ,  候補遺伝子 ,  マイクロRNA ,  発現配列タグ ,  生物的ストレス ,  抗酸化能 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 野菜  (FC03043X)

物質索引 (1件)： リコペン

タイトルに関連する用語 (7件)： トマト ,  Solanum ,  生物 ,  ストレス ,  遺伝子 ,  計算機 ,  解読