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J-GLOBAL ID：201702260007732248   整理番号：17A1118117

Reinekea forsetii’のゲノムおよび生理学的分析は,春の藻類ブルーム中の有用な日和見ライフスタイルを明らかにする【Powered by NICT】

Genomic and physiological analyses of ‘Reinekea forsetii’ reveal a versatile opportunistic lifestyle during spring algae blooms

著者 (12件)： Avci Burak (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen, 28359, Germany) ,  Hahnke Richard L. (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen, 28359, Germany) ,  Hahnke Richard L. (Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Inhoffenstrasse 7B, Braunschweig, 38124, Germany) ,  Chafee Meghan (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen, 28359, Germany) ,  Fischer Tanja (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen, 28359, Germany) ,  Gruber-Vodicka Harald (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen, 28359, Germany) ,  Tegetmeyer Halina E. (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen, 28359, Germany) ,  Tegetmeyer Halina E. (Institute for Genome Research and Systems Biology, Center for Biotechnology, University of Bielefeld, Universitaetsstrasse 27, Bielefeld, 33615, Germany) ,  Harder Jens (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen, 28359, Germany) ,  Fuchs Bernhard M. (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen, 28359, Germany) ,  Amann Rudolf I. (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen, 28359, Germany) ,  Teeling Hanno (Max Planck Institute for Marine Microbiology, Celsiusstrasse 1, Bremen, 28359, Germany)
資料名： Environmental Microbiology  (Environmental Microbiology)
巻： 19  号： 3  ページ： 1209-1221  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2561A  ISSN： 1462-2912  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： γプロテオバクテリアReinekea spp.は年間2009 2012における北海春藻類ブルーム中に検出され,細菌性プランクトンにおける16%までの相対的豊度であった。ここでは,(i)その人手アノテーション付き高品質閉じたゲノム,(ii)2009 2012ブルームからのin situデータの再分析および(iii)生理的試験を用いた2010年の春期ブルーム中単離された「R.forsetiiの歪Hel1_31_D35の生態生理学を調べた。16S rRNA遺伝子配列の高分解能解析は,「R.forsetii」が,これ等のブルーム中Reinekea個体群を支配していることを示唆した。これは2009と2010細菌プランクトンメタゲノムからほぼ完全なHel1_31_D35ゲノムの検索により確認された。Hel1_31_D35株は多様な糖単量体を含む多数の低分子量基質,マンナン,α-グルカン,および細菌性ペプチドグリカンのような少ないが関連する藻類多糖類を使用することができる。チオ硫酸硫酸を酸化し,無酸素条件下で発酵する。ブルーム中に生じるので,歪は藻類に付着可能であり,低リン酸塩濃度で増殖する。ゲノムはRTX毒素と分泌蛋白質をコードしており,栽培実験におけるHel1_31_D35粗細胞抽出物は北海Polaribacter菌株の増殖を阻害した。著者らのデータは,これらの形質の組み合わせは,春の植物プランクトンブルーム時に特に競合する汎用日和見歪Hel1_31_D35ことが示唆される。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 毒素 ,  個体群 ,  細菌 ,  *ゲノム ,  硫酸 ,  プランクトン ,  *生理学 ,  付着 ,  基質 ,  栽培 ,  *ブルーム ,  リン酸塩 ,  高分解能 ,  *春
準シソーラス用語： 菌株 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： ゲノム ,  生理学 ,  分析 ,  春 ,  藻類 ,  ブルーム ,  ライフスタイル