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J-GLOBAL ID：201702260256343313   整理番号：17A1626438

マンモス山(シベリア東部)の古代永久凍土沖積層中の細菌群集【Powered by NICT】

Bacterial community in ancient permafrost alluvium at the Mammoth Mountain (Eastern Siberia)

著者 (11件)： Brouchkov Anatoli (Lomonosov Moscow State University, Leninskie Gory, Moscow 119991, Russia) ,  Brouchkov Anatoli (Tyumen State University, Volodarskogo 6, Tyumen 625003, Russia) ,  Kabilov Marsel (Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, SB RAS, Lavrentiev Avenue 8, Novosibirsk 630090, Russia) ,  Filippova Svetlana (Winogradsky Institute of Microbiology, Research Center of Biotechnology of the Russian Academy of Sciences, Leninsky Avenue 33, bld. 2, Moscow 119071, Russia) ,  Baturina Olga (Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, SB RAS, Lavrentiev Avenue 8, Novosibirsk 630090, Russia) ,  Rogov Victor (Lomonosov Moscow State University, Leninskie Gory, Moscow 119991, Russia) ,  Galchenko Valery (Winogradsky Institute of Microbiology, Research Center of Biotechnology of the Russian Academy of Sciences, Leninsky Avenue 33, bld. 2, Moscow 119071, Russia) ,  Mulyukin Andrey (Winogradsky Institute of Microbiology, Research Center of Biotechnology of the Russian Academy of Sciences, Leninsky Avenue 33, bld. 2, Moscow 119071, Russia) ,  Fursova Oksana (Lomonosov Moscow State University, Leninskie Gory, Moscow 119991, Russia) ,  Pogorelko Gennady (NI Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia) ,  Pogorelko Gennady (Department of Plant Pathology and Microbiology, Iowa State University, Ames, IA 50011, USA)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 636  ページ： 48-53  発行年： 2017年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： マンモス山(シベリア東部)でアルダン河谷に露出する永久凍結(約3.5Ma)の沖積新第三紀堆積物は,ユニークな,古代,あまり研究されていない永久凍土環境である。今までのところ,常在細菌群集の構造は未知のままである。土壌(MOバイオ)及びQIAamp DNA Stool Mini Kit(Qiagen)のDNA Spin Kitを用いた全DNA単離と16Sメタゲノム解析の使用は,永久凍土沖積層堆積物に混入する主要や微量細菌系統を明らかにした。まとめると,31,239リード(Qiagenキット)と15,404リード(MoBioキット)61操作的分類単位(OTU)は既知の分類群に帰属することができた。,Bacteroidetes,ProteobacteriaとFirmicutesのみ三門はOTU豊度の>5%を構成し,全体の99%を占めていた。トップファミリー(Chitinophagaceae,Caulobacteraceae,Sphingomonadaceae,Bradyrhizobiaceae,Halomonadaceae)に関連するOTUは読取の90%以上を開催した。Actinobacteriaの豊度は少なかった(0.7%),他の門(Deinococcus-Thermus,藍藻類/葉緑体,Fusobacteria,Acidobacteria)のメンバーは,読み取りの小部分を構成した。研究した古代の沖積層中の細菌群集は他の永久凍土堆積物と異なり,主にBacteroidetes(>52%)の優位性。融解するよう促しと気候を変えて拡散ならば,この保存された細菌群集の多様性は,未知の影響を引き起こす可能性がある。それ故,本研究はこれらの古代細菌の再導入は,周囲の生態系,現在の細菌種を含むにどのように影響するか調べるさらなる理由を誘発する。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 藍藻類 ,  *沖積層 ,  *山岳 ,  生態系 ,  *細菌 ,  堆積物 ,  *永久凍土 ,  *シベリア ,  DNA【核酸】
準シソーラス用語： Firmicutes ,  プロテオバクテリア ,  バクテロイデス門 ,  *細菌群集 ,  *古代 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 新第三紀 ,  永久凍土 ,  細菌 ,  DNA ,  微生物個体群

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： マンモス ,  山 ,  シベリア ,  古代 ,  永久凍土 ,  沖積層 ,  細菌群集