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J-GLOBAL ID：201702261326869390   整理番号：17A1247858

Topmouthマウスカルタにおけるそれらの標的の深い配列決定と予測による保存されたおよび新規マイクロRNAの同定【Powered by NICT】

Identification of the conserved and novel microRNAs by deep sequencing and prediction of their targets in Topmouth culter

著者 (6件)： Huang Yong (College of Animal Science and Technology, Henan University of Science and Technology, Luoyang, China) ,  Gong Wangbao (Key Laboratory of Tropical & Subtropical Fishery Resource Application & Cultivation, Ministry of Agriculture, Pearl River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou, China) ,  Ren Hongtao (College of Animal Science and Technology, Henan University of Science and Technology, Luoyang, China) ,  Xiong Jianli (College of Animal Science and Technology, Henan University of Science and Technology, Luoyang, China) ,  Gao Xiaochan (College of Animal Science and Technology, Henan University of Science and Technology, Luoyang, China) ,  Sun Xihong (College of Animal Science and Technology, Henan University of Science and Technology, Luoyang, China)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 626  ページ： 298-304  発行年： 2017年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： マイクロRNA(miRNA)は生物のほとんどすべての生物学的過程の調節において重要な役割を果たす内因性非コード小RNAである。Topmouthカルタはその繊細と高い経済価値のための中国の淡水養殖システムにおける経済的に重要な魚種である。しかし,今日まで,miRNAはTopmouthカルタ種で報告されていない。本研究では,Topmouthカルタの肝臓,筋肉,ひ臓及び腎臓を採取して用いて深い配列決定のための小RNAライブラリーの構築である。273個の保存されたmiRNAs/miRNAs星と8の新規miRNAs/miRNAs星の全が発見され,これらのmiRNAは86種類のmiRNAファミリーに属している。特定位置でmiRNAヌクレオチド組成に及ぼす強塩基バイアスである。Uが主要なヌクレオチド,特に開始,中間,保存されたmiRNAの末端である。Topmouthカルタの8種類全ての同定したmiRNAsの発現はステムループqRT-PCRを用いて検証した。さらに,潜在的な標的がこれらのmiRNA,多様な生物学的過程に関与していることが分かったを予測した。著者らの研究は,TopmouthカルタmiRNAレパートリーを有意に最初のものであり,Topmouthカルタの成長と発育の進行における遺伝子発現のための複雑なmiRNA仲介調節ネットワークのさらなる解明のための基準を提供した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 養殖 ,  ヌクレオチド ,  バイアス ,  中華人民共和国 ,  *遺伝子発現 ,  脾臓 ,  淡水
準シソーラス用語： 遺伝子調節ネットワーク ,  qRT-PCR法 ,  RNAライブラリー ,  経済価値 ,  低分子RNA ,  内因性 ,  生物学的過程 ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Topmouthマウスカルタ ,  ディープシークエンシング ,  マイクロRNA ,  標的

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物の生化学  (EH01050J)

タイトルに関連する用語 (5件)： 標的 ,  予測 ,  保存 ,  マイクロRNA ,  同定