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J-GLOBAL ID：201702261431743950   整理番号：17A1550273

メキシコ,バハ・カリフォルニアからのヒトおよびウシ分離株の分子フィンガープリントを得るためのMycobacterium bovisの全ゲノム配列決定【Powered by NICT】

Whole genome sequencing of Mycobacterium bovis to obtain molecular fingerprints in human and cattle isolates from Baja California, Mexico

著者 (16件)： Sandoval-Azuara Sarai Estrella (Laboratorio de Epidemiologia y Ecologia Molecular, Escuela Ciencias de la Salud, Universidad Autonoma de Baja California, Blvd Zertuche y Blvd de los Lagos, Fracc, Valle Dorado, CP 22890, Ensenada, Baja California, Mexico) ,  Sandoval-Azuara Sarai Estrella (Facultad de Ciencias Marinas, Universidad Autonoma de Baja California,Tijuana - Ensenada road 103 km, CP 22860, Ensenada, Baja California, Mexico) ,  Muniz-Salazar Raquel (Laboratorio de Epidemiologia y Ecologia Molecular, Escuela Ciencias de la Salud, Universidad Autonoma de Baja California, Blvd Zertuche y Blvd de los Lagos, Fracc, Valle Dorado, CP 22890, Ensenada, Baja California, Mexico) ,  Perea-Jacobo Ricardo (Laboratorio de Epidemiologia y Ecologia Molecular, Escuela Ciencias de la Salud, Universidad Autonoma de Baja California, Blvd Zertuche y Blvd de los Lagos, Fracc, Valle Dorado, CP 22890, Ensenada, Baja California, Mexico) ,  Perea-Jacobo Ricardo (Facultad de Ciencias Marinas, Universidad Autonoma de Baja California,Tijuana - Ensenada road 103 km, CP 22860, Ensenada, Baja California, Mexico) ,  Robbe-Austerman Suelee (National Veterinary Services Laboratories, United States Department of Agriculture, 1015 N University Blvd, Ames, IA 50011, USA) ,  Perera-Ortiz Alejandro (United States Department of Agriculture, Animal and Plant Health Inspection Service, Mexico) ,  Lopez-Valencia Gilberto (Instituto de Investigaciones en Ciencias Veterinarias, Laboratorio de Tuberculosis y Brucelosis, Universidad Autonoma de Baja California, San Felipe road 3.5 km, Fracc, Campestre, CP 21386, Mexicali, Baja California, Mexico) ,  Bravo Doris M. (National Veterinary Services Laboratories, United States Department of Agriculture, 1015 N University Blvd, Ames, IA 50011, USA) ,  Sanchez-Flores Alejandro (Unidad Universitaria de Secuenciacion Masiva y Bioinformatica, Instituto de Biotecnologia, UNAM, Av. Universidad 2001, Chamilpa, CP 62210, Cuernavaca, Morelos, Mexico) ,  Miranda-Guzman Daniela (Instituto de Investigaciones en Ciencias Veterinarias, Laboratorio de Tuberculosis y Brucelosis, Universidad Autonoma de Baja California, San Felipe road 3.5 km, Fracc, Campestre, CP 21386, Mexicali, Baja California, Mexico) ,  Flores-Lopez Carlos Alberto (Facultad de Ciencias, Universidad Autonoma de Baja California, Tijuana - Ensenada road 103 km, CP 22860, Ensenada, Baja California, Mexico) ,  Zenteno-Cuevas Roberto (Instituto de Salud Publica, Universidad Veracruzana, Doctor Luis Castelazso, Industrial Aniimas, CP 91190, Xalapa Enriquez, Veracruz, Mexico) ,  Laniado-Laborin Rafael (Clinica de Tuberculosis, Hospital General de Tijuana, ISESALUD, Av. Centenario 10851, Zona Rio, CP 22680, Tijuana, Baja California, Mexico) ,  de la Cruz Fabiola Lafarga (Departamento de Acuicultura, Centro de Investigacion Cientifica y de Educacion Superacion de Ensenada, Carretera Ensenada-Tijuana No. 3918, Zona Playitas, CP 22860, Ensenada, Baja California, Mexico) ,  Stuber Tod P. (National Veterinary Services Laboratories, United States Department of Agriculture, 1015 N University Blvd, Ames, IA 50011, USA)
資料名： International Journal of Infectious Diseases  (International Journal of Infectious Diseases)
巻： 63  ページ： 48-56  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3271A  ISSN： 1201-9712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： バハカリフォルニア島からのウシおよびヒトMycobacterium bovis分離株の全ゲノム配列を比較することにより遺伝的多様性を明らかにする。Baja California,メキシコから得られたM.bovisの172分離株の分子フィンガープリントを得るために使用した全ゲノム配列決定戦略155分離株は牛からであり,17単離株はヒトであった。スポリゴタイプはin silico特性化し,分離株の間の単一ヌクレオチド多型(SNP)の差を評価した。全部で12M.bovisスポリゴタイプのパターンをウシおよびヒトで同定された。二つの優勢なスポリゴタイプパターンはウシおよびヒトの両方で見られた:SB0145とSB1040。SB0145スポリゴタイプはウシ分離株(n=91)及びヒト分離株の65%(n=11)の59%を占め,一方,SB1040スポリゴタイプはウシ分離株(n=47)とヒト分離株の30%(n=5)の30%を占めていた。SNP差を評価する場合,ヒト分離株はウシ分離株と絡み合った密接した。ヒトからの分離菌全てがウシ分離株で観察されたものと一致するspoligotypeパターンを有し,全てのヒト分離株はSNP解析に基づくバハカリフォルニアの牛と共通祖先を共有していた。これはBajaカリフォルニアにおけるM.bovisにより引き起こされる最もヒト結核では,Baja CaliforniaウシにおけるM.bovis循環に由来することを示唆した。これらの結果は,この領域におけるウシ結核サーベイランスと制御の重要性を強調した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *カリフォルニア州 ,  Mycobacterium ,  一塩基多型 ,  結核 ,  単離 ,  *メキシコ合衆国 ,  *ウシ型結核菌 ,  サーベイランス ,  キャラクタリゼーション ,  *ヒト
準シソーラス用語： SNP解析 ,  分離菌 ,  in silico ,  *ゲノム配列 ,  *分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Mycobacterium bovis ,  スポリゴタイプ ,  全ゲノム配列決定

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物の生態  (EG03040J)

タイトルに関連する用語 (8件)： メキシコ ,  ヒト ,  ウシ ,  分離株 ,  分子 ,  フィンガープリント ,  Mycobacterium ,  ゲノム配列