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J-GLOBAL ID：201702261603480766   整理番号：17A1629371

パキスタンからの広範囲薬剤耐性結核菌分離株における排出ポンプ遺伝子の一塩基多型【Powered by NICT】

Single nucleotide polymorphisms in efflux pumps genes in extensively drug resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from Pakistan

著者 (14件)： Kanji Akbar (Department of Pathology and Laboratory Medicine, Aga Khan University Hospital, Karachi, Pakistan) ,  Hasan Rumina (Department of Pathology and Laboratory Medicine, Aga Khan University Hospital, Karachi, Pakistan) ,  Ali Asho (Faculty of Microbiology, King Abdulaziz University, Saudi Arabia) ,  Zaver Ambreen (Department of Pathology and Laboratory Medicine, Aga Khan University Hospital, Karachi, Pakistan) ,  Zhang Ying (Department of Molecular Microbiology and Immunology, Bloomberg School of Public Health, Johns Hopkins University, Baltimore, MD, 21205, USA) ,  Imtiaz Kehkashan (Department of Pathology and Laboratory Medicine, Aga Khan University Hospital, Karachi, Pakistan) ,  Shi Wanliang (Department of Molecular Microbiology and Immunology, Bloomberg School of Public Health, Johns Hopkins University, Baltimore, MD, 21205, USA) ,  Clark Taane G. (Faculty of Infectious and Tropical Diseases, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, United Kingdom) ,  Clark Taane G. (Faculty of Epidemiology and Population Health, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, United Kingdom) ,  McNerney Ruth (Lung Infection and Immunity Unit, Division of Pulmonology, Department of Medicine, University of Cape Town, and UCT Lung Institute, Cape Town, South Africa) ,  Phelan Jody (Faculty of Infectious and Tropical Diseases, London School of Hygiene and Tropical Medicine, London, United Kingdom) ,  Rao Shoaib (Department of Pathology and Laboratory Medicine, Aga Khan University Hospital, Karachi, Pakistan) ,  Shafiq Samreen (Department of Pathology and Laboratory Medicine, Aga Khan University Hospital, Karachi, Pakistan) ,  Hasan Zahra (Department of Pathology and Laboratory Medicine, Aga Khan University Hospital, Karachi, Pakistan)
資料名： Tuberculosis  (Tuberculosis)
巻： 107  ページ： 20-30  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3216A  ISSN： 1472-9792  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 耐性関連遺伝子の変動が大きいため,Mycobacterium tuberculosis(MTB)における薬剤耐性の機構を理解するために挑戦的である。排出ポンプ遺伝子は薬剤耐性に寄与し,この複雑性を増す。排出ポンプ遺伝子蛋白質スーパーファミリーは薬剤耐性株のゲノム分析とin vitro転写研究により特性化した。しかし,広範囲薬剤耐性(XDR)結核(TB)分離株における排出ポンプ遺伝子に関する情報は限られている。37広範囲薬剤耐性(XDR)と五の薬剤感受性(DS)MTB臨床分離株の全ゲノムシークエンシング(WGS)に基づく解析を行った。排出ポンプ遺伝子Rv0194,Rv1217,Rv1218,drrA,drrB,Rv1258,Rv1634,Rv2688,Rv1273,Rv1819,Rv1458,Rv1877とRv1250における一塩基多型(SNP)はH37Rv参照株と比較して,臨床分離株で測定した。XDR株で同定されたSNPの対立遺伝子頻度はDS株と比較した。Rv0194,Rv2688,Rv1634,drrAとdrrBの遺伝子発現はXDR-TB分離株(n=9),DS TB株(n=4)およびH37Rvで決定した。DS株における非常に低い周波数でユニークなまたは存在したXDR-TB分離株におけるSNPsを同定した;Rv0194G170V;Rv1217L151R;Rv1258P369TとG391R;Rv1273S118GとI175T;Rv1877I534T;Rv1250V318X/AとS333A,Rv2688P156T。Rv2688とdrrBの発現はDS TB株と比較して,XDR-TBで上昇していることを見出した。分離株における増加した薬剤耐性に関連する可能性のある排出ポンプ遺伝子のユニークなSNPsを同定した。抗生物質の非存在下でもXDR株で観察されたRv2688とdrrB排出ポンプ遺伝子発現レベルの増加は,これらの臨床分離株は治療により難分解性であることを示唆する。直接MTBにおける抵抗の増加とこれらの変異を結びつけるためにさらなる研究が必要である。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： in vitro実験 ,  *薬物耐性 ,  抗生物質 ,  遺伝子発現 ,  遺伝子頻度 ,  *一塩基多型 ,  キャラクタリゼーション ,  タンパク質 ,  臨床分離菌 ,  *遺伝子 ,  ゲノム ,  薬剤感受性 ,  *結核
準シソーラス用語： *排出ポンプ ,  *分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 広範囲薬剤耐性 ,  Mycobacterium tuberculosis ,  一塩基多型 ,  排出ポンプ

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (7件)： パキスタン ,  広範囲薬剤耐性結核 ,  菌 ,  分離株 ,  排出ポンプ ,  遺伝子 ,  一塩基多型