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J-GLOBAL ID：201702262147021044   整理番号：17A1629434

疾患リスク機能的SNPと相互作用ネットワークに基づく複雑な慢性疾患の感受性遺伝子の同定【Powered by NICT】

Identification of susceptible genes for complex chronic diseases based on disease risk functional SNPs and interaction networks

著者 (8件)： Li Wan (College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University, Harbin, Heilongjiang Province, China) ,  Zhu Lina (College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University, Harbin, Heilongjiang Province, China) ,  Huang Hao (College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University, Harbin, Heilongjiang Province, China) ,  He Yuehan (College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University, Harbin, Heilongjiang Province, China) ,  Lv Junjie (College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University, Harbin, Heilongjiang Province, China) ,  Li Weimin (Department of Cardiology, The First Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, Heilongjiang Province, China) ,  Chen Lina (College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University, Harbin, Heilongjiang Province, China) ,  He Weiming (Institute of Opto-Electronics, Harbin Institute of Technology, Harbin, Heilongjiang Province, China)
資料名： Journal of Biomedical Informatics  (Journal of Biomedical Informatics)
巻： 74  ページ： 137-144  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0827A  ISSN： 1532-0464  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 複雑な慢性疾患は,遺伝的および環境因子の影響に起因する。,一つの共通型遺伝的変異の単一ヌクレオチド多型(SNPs)は,疾患において重要な役割を果たした。コード領域と蛋白質相互作用ネットワークモジュールにおける疾患リスク機能的SNPは複雑であった慢性疾患の疾患感受性遺伝子の同定に寄与する可能性が高いことを仮定した。これは複雑な慢性疾患の病因を更に明らかにするための助けとなるであろう。疾患リスクSNPは,最初の冠動脈性心疾患(CHD),高血圧(HT)および2型糖尿病(T2D)のための公共SNPデータから認められた。いくつかのSNP機能的アノテーションデータベースを統合することによってナンセンスとミスセンスに分類されるコード領域のSNPは機能的SNPとして処理した。,各疾患と有意に関連して領域は疾患リスク機能的SNPのためのランダム順列を用いてスクリーニングした。これらの領域に対応して,155年,169年及び173潜在的疾患感受性遺伝子は,CHD,HTおよびT2Dでそれぞれ同定した。環境状況における疾患関連遺伝子産物相互作用ネットワークは,これらの疾患に対する遺伝子と潜在的疾患感受性遺伝子の両方の相互作用する遺伝子産物のために構築した。疾患関連モジュールの機能的濃縮分析後,5CHD感受性遺伝子,7HT感受性遺伝子と3T2D感受性遺伝子は最終的に同定され,そのうちのいくつかは多面発現効果を有していた。これらの遺伝子の大部分は,文献でこれらの疾患に関連していることを確認した。これは異なる観点からLeeらによって提案された他の方法から同定された疾患遺伝子で類似していた。本研究では,他の疾患のための複雑な慢性疾患と感受性遺伝子同定の診断と治療のための新しい展望を提供することができた。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *ネットワーク ,  冠動脈疾患 ,  一塩基多型 ,  *感受性 ,  *相互作用 ,  *遺伝子 ,  高血圧症 ,  病因 ,  *遺伝 ,  2型糖尿病
準シソーラス用語： 疾患遺伝子 ,  疾患感受性遺伝子 ,  環境因子 ,  *感受性遺伝子 ,  *慢性疾患 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 複雑な慢性疾患 ,  疾患リスクSNP ,  機能的SNP ,  ネットワークモジュール ,  機能的濃縮分析

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (7件)： 疾患 ,  リスク ,  SNP ,  相互作用 ,  慢性疾患 ,  感受性遺伝子 ,  同定