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J-GLOBAL ID：201702262384178928   整理番号：17A0439536

配列決定データからのRNA-RNA相互作用の正確な予測のためのアクセシビリティ組み入れ法

An accessibility-incorporated method for accurate prediction of RNA-RNA interactions from sequence data

著者 (6件)： KATO Yuki (Osaka Univ., Osaka, JPN) ,  MORI Tomoya (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  SATO Kengo (Keio Univ., Kanagawa, JPN) ,  MAEGAWA Shingo (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  HOSOKAWA Hiroshi (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  AKUTSU Tatsuya (Kyoto Univ., Kyoto, JPN)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 2  ページ： 202-209  発行年： 2017年01月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 新しく編集されたデータセットにおけるアクセシビリティに基づく予測モデルPactPAceの有効性を示した。PactPAceは,最新の方法と比べて実験的に証明された相互作用の新しく編集されたデータセットにおいて最良の予測能を達成することを相互作用部位予測における第1の実験が示した。そのうえ,今回の方法を含むアクセシビリティに基づく方法は,真の相互作用RNAの識別において有効であることを正および負相互作用対の間の識別における第2の実験が明らかにした。

シソーラス用語： 遺伝学実験技術 ,  *ヌクレオチド配列 ,  *分子間相互作用 ,  *RNA【核酸】 ,  予測 ,  *アクセシビリティ ,  編集 ,  集合 ,  データ ,  実験
準シソーラス用語： *ヌクレオチド配列決定 ,  *RNA-RNA相互作用 ,  データセット

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子間相互作用  (BH07020P) ,  核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (4件)： RNA-RNA相互作用 ,  予測 ,  アクセシビリティ ,  組み入れ