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J-GLOBAL ID：201702262443326557   整理番号：17A1384730

嚢胞形成を調節する重要なトランスクリプトーム変化を明らかにするための常染色体優性多発性嚢胞腎障害(ADPKD)におけるプロファイリング保存された生物学的経路:異種間メタ分析アプローチ【Powered by NICT】

Profiling conserved biological pathways in Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disorder (ADPKD) to elucidate key transcriptomic alterations regulating cystogenesis: A cross-species meta-analysis approach

著者 (3件)： Chatterjee Shatakshee (National Institute of Biomedical Genomics, Netaji Subhas Sanatorium (T.B. Hospital), 2nd Floor, P.O.: N.S.S., Kalyani 741251, West-Bengal, India) ,  Verma Srikant Prasad (National Institute of Biomedical Genomics, Netaji Subhas Sanatorium (T.B. Hospital), 2nd Floor, P.O.: N.S.S., Kalyani 741251, West-Bengal, India) ,  Pandey Priyanka (National Institute of Biomedical Genomics, Netaji Subhas Sanatorium (T.B. Hospital), 2nd Floor, P.O.: N.S.S., Kalyani 741251, West-Bengal, India)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 627  ページ： 434-450  発行年： 2017年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 流体で満たされた嚢胞の開始と進行は常染色体優性多発性嚢胞腎(ADPKD)を示している。,嚢胞形成を標的とする改善された治療は一定の課題として残っている。限られた試料サイズを持つ単一ADPKD動物モデル種におけるマイクロアレイの実験では,ADPKD発症機序に関する散乱ビューを提供する傾向がある。治療のための重要な標的であるかもしれないことを保存された生物学的経路をプロファイルするための交雑種のメタ分析を行うことを目的とした。ラット,マウス及び人に関する九ADPKDマイクロアレイデータセットは著者らの研究基準を満たし,選択した。種内組合せ解析は回分効果の除去を考慮した後に実施した。有意に濃縮されたGO生物学的プロセスとKEGG経路を計算し,それらの重複が観察された。保存された経路のために,生物学的モジュールと遺伝子調節ネットワークが観察された。分子署名データベース(MSigDB)を用いた遺伝子集合濃縮解析(GSEA)は保存された経路で見出された遺伝子に対し行った。は有意に濃縮されたGOプロセスの28モジュールとヒトで保存されている有意に濃縮されたKEGG経路,すなわち全体的なトランスクリプトームに影響摂動のう胞形成を示唆するマウスおよびラット,増殖と進行から5種の主な機能的カテゴリーを得た。ゲノム不安定性,ERにおける蛋白質局在性とインシュリン抵抗性などのアップレギュレートされた遺伝子から得られた有意に富んだ経路は嚢胞形成と成長を調節することが見出された増加した細胞接着と炎症に起因する嚢胞進行は血管新生,TGF-β,CAM,および感染関連経路の摂動により示唆された。,ネットワークはエンドサイトーシスとTGF-βのSMAD2とSMAD7例えば経路間の共有遺伝子を明らかにした。著者らの研究はいくつかの重要な規制緩和された経路の間の相互作用の結果であることが嚢胞形成と進行を示唆している。ADPKD改善のための組合せ治療法を開発することに焦点を当てて必要である,今後のトランスレーショナル研究。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： インスリン抵抗性 ,  TGFβ ,  細胞接着 ,  遺伝子 ,  *嚢胞 ,  タンパク質 ,  *メタ分析 ,  相互作用 ,  炎症 ,  ヒト ,  *トランスクリプトーム ,  ネットワーク ,  データベース ,  治療法
準シソーラス用語： マイクロアレイ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ADPKD ,  マイクロアレイ ,  Pathways ,  メタ分析 ,  保存された ,  Enrichment

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (11件)： 嚢胞 ,  調節 ,  トランスクリプトーム ,  常染色体優性多発性嚢胞腎 ,  障害 ,  ADPKD ,  プロファイリング ,  保存 ,  生物学 ,  経路 ,  メタ分析