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J-GLOBAL ID：201702262497079410   整理番号：17A1520442

サツマイモにおけるTD-SSR-PCR反応システムの最適化についての最適化を行った。【JST・京大機械翻訳】

Optimization of TD-SSR-PCR System on Sweet Potato

著者 (4件)： Nan Wenzhuo (海南大学園芸園林学院,海南海口,570228) ,  Zheng Danwei (海南大学園芸園林学院,海南海口,570228) ,  Zhu Guopeng (海南大学園芸園林学院,海南海口,570228) ,  Zhang Xiaobei (海南大学園芸園林学院,海南海口,570228)
資料名： Redai Zuowu Xuebao  (Redai Zuowu Xuebao)
巻： 38  号： 1  ページ： 89-93  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2969A  ISSN： 1000-2561  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： サツマイモの最も良いTD-SSR-PCRシステムを探索するために,L16(43)直交設計を用いて,2×PCR Mix,プライマー,テンプレートDNAなどの主要な影響因子の適切な濃度を研究し,これに基づいて増幅プログラムとポリアクリルアミドゲル電気泳動のサンプル量を最適化した。結果は,最適化されたTD-SSR-PCR反応システムが,以下の通りであることを示した。10μL 2×PCR Mix、100ng鋳型DNA、0.4μmol/Lプライマー、1μLグリセリン、総体積20μL;最適化後の増幅プログラムは以下の通りであった。94°Cで4min,94°Cで45s,Tm+5°C~Tm-5°C(1サイクル当たりのアニーリング温度を0.5°C下げ,1‰のプライマーで小さい‰)を30sアニールした(アニーリング時間は増幅断片サイズが異なる),72°Cで1minで20サイクル延長した。94°C変性45s,Tm-5°C焼なまし30s,72°C延伸1minで15サイクル,最後に72°C延伸7min,4°Cで保存した。ポリアクリルアミドゲル電気泳動におけるサンプルの量は1.5~2μLであった。これらの条件下で,Z37を用いて10のサツマイモ材料のPCR増幅を行い,得られたバンドは明瞭で,多形性が高く,この条件がサツマイモのTD-SSR-PCR反応システムに適していることを示した。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *最適化 ,  焼なまし ,  *サツマイモ ,  DNA【核酸】 ,  延伸 ,  *反応系 ,  PCR法
準シソーラス用語： 多型性 ,  アニーリング温度 ,  影響因子 ,  直交設計 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： sweet potato ,  TD-SSR-PCR ,  orthogonal design ,  2×PCR Mix ,  the best sample amount

分類 (3件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  電気泳動分析  (CC04017K)

タイトルに関連する用語 (2件)： サツマイモ ,  最適化