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J-GLOBAL ID：201702262598939371   整理番号：17A0835748

LRFragLib de novo蛋白質構造予測のためのフラグメントを同定するための有効アルゴリズム

LRFragLib: an effective algorithm to identify fragments for de novo protein structure prediction

著者 (4件)： WANG Tong (Tsinghua Univ., Beijing, CHN) ,  YANG Yuedong (Griffith Univ., QLD, AUS) ,  ZHOU Yaoqi (Griffith Univ., QLD, AUS) ,  GONG Haipeng (Tsinghua Univ., Beijing, CHN)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 33  号： 5  ページ： 677-684  発行年： 2017年03月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多段階で柔軟な選択プロトコルを用いた7-10残基の低ホモロジーフラグメントの検出を改善するためのフラグメント-ライブラリー構築,LRFragLibを紹介した。ロジスティック回帰スコアリングモデルに基づいて天然に近い構造でのCASP蛋白質セットにおける高い精度および匹敵する被覆を達成することにより,LRFragLibは現存法を凌駕した。また,この方法は,記憶装置利用の減少を持つ現存の最速法に匹敵する計算効率を有した。

シソーラス用語： *予測技法 ,  *タンパク質 ,  *分子構造 ,  *アルゴリズム ,  フラグメント ,  基 ,  立体配座 ,  ホモロジー ,  検出 ,  ライブラリ【計算機】 ,  回帰モデル ,  ロジスティック曲線 ,  多変量解析 ,  精度 ,  被覆 ,  記憶装置 ,  効率 ,  計算
準シソーラス用語： *蛋白質構造予測 ,  残基 ,  ロジスティック回帰モデル ,  計算効率

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  数値計算  (JE02000J)

タイトルに関連する用語 (4件)： 蛋白質構造予測 ,  フラグメント ,  同定 ,  アルゴリズム