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J-GLOBAL ID:201702262957249525   整理番号:17A1625311

ビスフェノールAによるゼブラフィッシュ(Danio rerio)胚の代謝破壊統合メタボロミクスとトランスクリプトームアプローチ【Powered by NICT】

Metabolic disruption of zebrafish (Danio rerio) embryos by bisphenol A. An integrated metabolomic and transcriptomic approach
著者 (7件):
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巻: 231  号: P1  ページ: 22-36  発行年: 2017年 
JST資料番号: D0984B  ISSN: 0269-7491  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: イギリス (GBR)  言語: 英語 (EN)
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ビスフェノールA(BPA)は一般的に内分泌撹乱物質として認識されているが,その曝露の代謝的影響はまだ十分に理解されていない。本研究では,代謝効果と最初の120時間中のゼブラフィッシュ胚を曝露BPAへの下位の調節経路を明らかにするために,全ゲノム,ハイスループットRNA配列決定(RNA Seq)と組み合わせた非標的LC-MSに基づくメタボロミクス解析を示した受精後。LC-MSおよびRNA-Seq複雑なデータセットからの生化学的情報を抽出し,表現型の有害効果の検証可能な予測を行うために多変量データ解析法を適用した。メタボロームとトランスクリプトームデータは変化した経路の類似したサブセットを明らかにした,同定されたバイオマーカーの数(約50代謝産物と1000以上の遺伝子)の大きな差にもかかわらず。これらの結果は,ゼブラフィッシュメタボロームの中程度の被覆率は,広範囲の代謝的変化を代表する可能性があることを示唆した。これらマルチオミックス応答は,異なるシグナル伝達経路に影響を及ぼすBPAによる特異的代謝破壊を示し,レチノイドとプロスタグランジン代謝のような。トランスクリプトームおよびメタボロームデータの組合せは,いずれかの単一データセットから描くことができない結果の動的解釈を可能にした。これらの結果は,影響経路の適応を越えた毒性物質の生理的影響を特性化するためのオミックス統合分析の有用性を示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】
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