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J-GLOBAL ID：201702262986905038   整理番号：17A0125097

動物遺伝子の天然アンチセンス転写物を検出し,検証するための効率的で迅速な方法【Powered by NICT】

An efficient and rapid method to detect and verify natural antisense transcripts of animal genes

著者 (11件)： Zhang Li (Agricultural College, Guangdong Ocean University) ,  Zhao Rui (Agricultural College, Guangdong Ocean University) ,  Xiao Mei (Agricultural College, Guangdong Ocean University) ,  Lin Shudai (South China Agricultural University) ,  Li Bixiao (South China Agricultural University) ,  Qiu Fengfang (South China Agricultural University) ,  Ma Jinge (South China Agricultural University) ,  Zhang Dexiang (South China Agricultural University) ,  Nie Qinghua (South China Agricultural University) ,  An Lilong (Agricultural College, Guangdong Ocean University) ,  Zhang Xiquan (South China Agricultural University)
資料名： Nongye Kexue Xuebao(Yingwenban)  (Nongye Kexue Xuebao(Yingwenban))
巻： 15  号： 9  ページ： 2070-2076  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2625A  ISSN： 2095-3119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ハイスループット配列決定は多数のセンス-アンチセンス転写ペアの,これらの遺伝子は,両方向から転写されたことを示しているが同定されている。最近の報告は,多くのアンチセンスRNA,特にlncRNA(長鎖ノンコーディングRNA)は,RNA二本鎖を形成することによりセンスRNAと相互作用することができることを示した。RNA配列,ノーザンブロット,RNアーゼ保護アッセイと鎖特異的PCRのような,多くの方法がアンチセンス転写物および遺伝子転写配向を検出するために使用できる。しかし,これらの方法の応用は高コスト,やっかいな手術あるいは不正確さのために,ある程度,拘束,特に実質的な量のデータの解析に関するされてきた。はこれらの複雑なRNAを検出し,検証するために簡単な方法を開発した。センス及びアンチセンス転写産物を解析するためのRT-PCRの鎖特異性とS1エンドヌクレアーゼの一本鎖特異性を利用した。四既知遺伝子,マウスβ-アクチンとTsix(XistアンチセンスRNA),ニワトリLXN(ラテキシン)とGFM1(G延長因子,ミトコンドリア1)を含む,を用いて,この方法を確立することであった。これら四遺伝子は,プラス鎖,マイナス鎖またはDNAの両鎖から研究し,転写された,全ての可能なケースを示した。結果は,この方法が,アンチセンス及びセンス-アンチセンス転写ペアを容易に区別できることを示した。添加では,ハイスループット配列決定の結果を検証するために,RNA間の調節機構を解析するために用いることができる。この方法は,検出の精度を改善することができ,主に単一遺伝子を解析するのに用いることができ,低コストである。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： アンチセンスRNA ,  アクチン ,  動物 ,  RT-PCR法 ,  長鎖 ,  ミトコンドリア ,  ノーザンブロット法 ,  *遺伝子 ,  DNA【核酸】 ,  エンドヌクレアーゼ ,  RNA【核酸】
準シソーラス用語： 特異性 ,  転写産物 ,  非翻訳RNA ,  ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 天然アンチセンス転写産物 ,  転写配向 ,  検出法 ,  RNA配列決定 ,  長鎖非コードRNA

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： 動物 ,  遺伝子 ,  転写 ,  検証