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J-GLOBAL ID：201702263054776262   整理番号：17A1818105

単一分子FRETによる制限エンドヌクレアーゼNgoMIV DNA相互作用の動力学のプロービング【Powered by NICT】

Probing the dynamics of restriction endonuclease NgoMIV-DNA interaction by single-molecule FRET

著者 (3件)： Tutkus Marijonas (Institute of Physics, Center for Physical Sciences and Technology, Savanoriu 231, Vilnius, 02300, Lithuania) ,  Sasnauskas Giedrius (Institute of Biotechnology, Vilnius University, Sauletekio av. 7, Vilnius, 10257, Lithuania) ,  Rutkauskas Danielis (Institute of Physics, Center for Physical Sciences and Technology, Savanoriu 231, Vilnius, 02300, Lithuania)
資料名： Biopolymers  (Biopolymers)
巻： 107  号： 12  ページ： ROMBUNNO.23075  発行年： 2017年 
JST資料番号： C0766A  ISSN： 0006-3525  CODEN： BIPMAA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くのII型制限エンドヌクレアーゼの活性最適化にはその認識配列の二コピーを必要とする。このような酵素による二DNA部位の同時結合はDNAループを生成した。ここでは,四量体エンドヌクレアーゼNgoMIVにより誘導されるDNAループ形成の動力学を研究するために表面固定化DNA断片の単一分子Forster共鳴エネルギー移動(smFRET)を利用した。二NgoMIV認識部位を持つDNA断片及び蛋白質誘導性DNAループに染料は,FRETシグナルをもたらす近接にもたらすことをこのようなFRET色素対を採用した。DNA NgoMIV相互作用の動力学は不均一である,広く異なる平均ループ状態継続長を示す個々のsmFRET軌跡をもつことが証明された。異なるタイプの動力学は,異なるタイプのDNA-蛋白質複合体の,二種の特異的部位(「遅い」軌道)に結合した同時にNgoMIV四量体または二DNA結合NgoMIV四量体(「速い」軌道)の半特異相互作用により仲介されるだけでなく,個々のNgoMIV分子の立体配座不均一性に起因していた。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 最適化 ,  *DNA【核酸】 ,  立体配座 ,  *エンドヌクレアーゼ ,  四量体 ,  タンパク質複合体 ,  *DNA制限酵素 ,  タンパク質 ,  *相互作用 ,  不均一性 ,  色素 ,  染料
準シソーラス用語： 共鳴エネルギー移動 ,  固定化DNA ,  *単一分子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： DNAループ形成 ,  heterogeneity ,  運動論的スキーム ,  PIFE ,  速度定数

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (6件)： 単一分子 ,  FRET ,  制限エンドヌクレアーゼ ,  DNA ,  相互作用 ,  動力学