局所SWATH図書館建築のための分別プロテオミクスの比較【Powered by NICT】

Govaert Elisabeth; Van Steendam Katleen; Willems Sander; Vossaert Liesbeth; Dhaenens Maarten; Deforce Dieter

文献

J-GLOBAL ID：201702263274885817 整理番号：17A1244115

局所SWATH図書館建築のための分別プロテオミクスの比較【Powered by NICT】

Comparison of fractionation proteomics for local SWATH library building

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資料名：
巻： 17 号： 15-16 ページ： null 発行年： 2017年
JST資料番号： W1303A ISSN： 1615-9853 CODEN： PROTC 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

すべて理論的フラグメントイオンスペクトル(SWATH(小水線面積双胴)の逐次窓取得によるデータ獲得のために,データ依存獲得(DDA)の参照ライブラリーはペプチド同定のフラグメントイオンスペクトルからの定量的データを相関させるために用いられる。SWATH(小水線面積双胴データを処理するとき,そのような参照ライブラリーの品質と被覆率が重要である。一般に,ライブラリーサイズは反復ランまたは分別とDDA前駆体選択の影響を減少させることによって増加させることができる。しかし,これらの戦略は図書館学とSWATH(小水線面積双胴測定の間の一致に影響し,より大きなライブラリーサイズは必ずしも改善されたSWATH(小水線面積双胴定量には対応していない。局所ライブラリーサイズを増加させるために三分別戦略は,反復DDA注入を用いた標準図書館建築:蛋白質SDS-PAGE分画,ペプチド高pH RP-HPLC分画とMS獲得気相分画と比較した。SWATH(小水線面積双胴性能に対するこれらのライブラリーの影響を抽出したペプチドと蛋白質の数,ペプチドの適合品質と遷移の抽出再現性の点で評価した。これらの分析は,ヒト胚性幹細胞の分化の親水性プロテオームを用いて行った。著者らの結果は,SWATH(小水線面積双胴定量的結果と解釈は分画法の選択によって影響されることを示した。データは識別子PXD006190であるProteomeXchangeを介して利用可能である。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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分子構造 , 生物学的機能

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