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J-GLOBAL ID：201702263371457195   整理番号：17A1924530

O2:6H11およびNM大腸菌CRISPRの分子分布特性とstxファージとの関係について検討すること。およびそれらの間の関係を明らかにすることを目的とした。【JST・京大機械翻訳】

Association between phage-mediated shiga toxin and molecular distribution of CRISPR in Escherichia coli O26 : H11 or NM

著者 (9件)： Long Jinzhao (450001,鄭州大学公共衛生学院) ,  Xu Yake (450001,鄭州大学公共衛生学院) ,  Duan Guangcai (450001 鄭州大学公共衛生学院;453003 新郷医学院分子診断与医学検験技術河南省協同創新中心) ,  Liang Wenjuan (450001 鄭州大学公共衛生学院;453003 新郷医学院分子診断与医学検験技術河南省協同創新中心) ,  Liu Huiying (450001,鄭州大学公共衛生学院) ,  Chen Shuaiyin (450001,鄭州大学公共衛生学院) ,  Xi Yuanlin (450001,鄭州大学公共衛生学院) ,  Wang Pengfei (河南科技大学校医院, 洛陽,471023) ,  Wang Yingfang (河南科技大学預防医学教研室, 洛陽,471023)
資料名： Zhonghua Liuxingbingxue Zazhi  (Zhonghua Liuxingbingxue Zazhi)
巻： 38  号： 7  ページ： 944-949  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2330A  ISSN： 0254-6450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】O2を調査する。H11及びNM血清型大腸菌におけるクラスター形成規則性間隔短い反復配列(CRISPR)の分子分布特徴及びstXファージとの関係を調べた。方法:135株のO2;H11およびNM血清型大腸菌をNCBIデータベースから取得し、CRTソフトおよびCRISPR Finderを用いてCRISPR情報を抽出し、Excelソフトを用いて間隔配列に対して番号を分析し、CRISPRサブタイプを分析した。CRISPRとstxファージの間の関係を分析した。結果:135株のO2;H11およびNM血清型大腸菌にはCRISPR構造があり、CRISPR1は19のサブタイプを含み、CRISPR2.1は22のサブタイプを含み、CRISPR2.2は1つのサブタイプを含む。CRISPR3-4は,1つのサブタイプを含み,stxは,CRISPRグループCにおいて発現し,そして,stx+菌株は,six-菌株より多くの間隔配列を示した。【結論】CRISPR遺伝子座は,O2において,6:1に位置している。H11またはNM血清型大腸菌に広く存在し、しかも異なる亜型が存在し、stxファージはCRISPRの分子分布特徴と関係があり、高毒株の分子標的を同定することができる可能性がある。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 布特性 ,  データベース ,  *大腸菌 ,  血清型 ,  クラスタ形成 ,  *バクテリオファージ ,  規則度
準シソーラス用語： 分子標的 ,  菌株 ,  サブタイプ ,  Excel ,  NCBI ,  *CRISPR配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Escherichia coli ,  Clustered regularly interspaced short palindromic repeat ,  Stx phage

分類 (2件)： 微生物感染の生理と病原性  (EG03053T) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： O2 ,  大腸菌 ,  CRISPR ,  分子 ,  布特性 ,  STX ,  ファージ