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J-GLOBAL ID：201702263703020071   整理番号：17A1270605

MapReduceとHadoopを用いたゲノム配列決定技術的レビュー【Powered by NICT】

Genome sequencing using MapReduce and Hadoop - A technical review

著者 (2件)： Patel Divya D. (Dept. of Computer Technology, Yeshwantrao Chavan College of Engineering, Nagpur, India) ,  Singh Kavita R. (Dept. of Computer Technology, Yeshwantrao Chavan College of Engineering, Nagpur, India)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2017  号： ICIMIA  ページ： 544-547  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生物のDNAに見出された遺伝情報を読み,変換するために研究者を可能にする技術はゲノム配列決定と呼ばれている。ゲノム配列決定はDNAに見出されたヌクレオチドサブユニットのため,短いリードと呼ばれる塩基の少数から成るを求めることである。ヒトゲノムは長さが約三十億塩基,月または年が単一機械上で処理されるべきかかるであろうである。多数短い読み込みのはそのような配列決定で利用可能である。これらのケースでは,データ解析パイプラインの第一段階は短リードマッピングの問題である。速度は膨大な量のデータのために著しく重要であり挑戦的になりつつある。本論文では,入力としてDNA配列決定のデータセットを探索は,大規模ゲノム配列決定応用のための効率的にするHadoopのMapReduce実装を適用してクラスタマシンを越えてこれらの物質を分割する手法を提案した。Copyright 2017 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： *DNA【核酸】 ,  データ解析 ,  遺伝情報
準シソーラス用語： DNA配列 ,  ヒトゲノム ,  *ゲノム配列 ,  *Hadoop ,  *MapReduce , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： MapReduce ,  Hadoop ,  ゲノム配列 ,  レビュー