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J-GLOBAL ID：201702263800334521   整理番号：17A1242854

候補superphylum Parcubacteria(OD1)内のチャレンジャー海淵,マリアナ海溝から得られた単一細胞ゲノムの代謝能【Powered by NICT】

The metabolic potential of the single cell genomes obtained from the Challenger Deep, Mariana Trench within the candidate superphylum Parcubacteria (OD1)

著者 (9件)： Leon-Zayas Rosa (Marine Biology Research Division, Scripps Institution of Oceanography, University of California San Diego, La Jolla, CA, 92093, USA) ,  Leon-Zayas Rosa (School of Marine Science and Policy, University of Delaware, Lewes, DE, 19958, USA) ,  Peoples Logan (Marine Biology Research Division, Scripps Institution of Oceanography, University of California San Diego, La Jolla, CA, 92093, USA) ,  Biddle Jennifer F. (School of Marine Science and Policy, University of Delaware, Lewes, DE, 19958, USA) ,  Podell Sheila (Marine Biology Research Division, Scripps Institution of Oceanography, University of California San Diego, La Jolla, CA, 92093, USA) ,  Novotny Mark (Microbial and Environmental Genomics, J. Craig Venter Institute, San Diego, CA, 92121, USA) ,  Cameron James (Earthship Productions, 3806 Cross Creek Rd. Suite D, Malibu, CA, 90265-4975, USA) ,  Lasken Roger S. (Microbial and Environmental Genomics, J. Craig Venter Institute, San Diego, CA, 92121, USA) ,  Bartlett Douglas H. (Marine Biology Research Division, Scripps Institution of Oceanography, University of California San Diego, La Jolla, CA, 92093, USA)
資料名： Environmental Microbiology  (Environmental Microbiology)
巻： 19  号： 7  ページ： 2769-2784  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2561A  ISSN： 1462-2912  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 候補門(CP)は培養代表種を欠く生物の広い系統発生クラスターである。この画分には,候補Parcubacteria上門である。Parcubacteriaに帰属される特異的特性は,エネルギー獲得のための発酵に及ぼす減少したゲノムサイズ,限られた代謝能と専用依存性である。,海洋と地表下のような新しい環境ニッチの研究はしばしば分類群の遺伝的潜在能力の理解を拡大する。この理由から,マリアナ海溝のチャレンジャー海淵で採取した堆積物試料から12Parcubacteria単一増幅ゲノム(SAG),深海挑戦(DSC)調査時に得られたを分析した。これらSAGの多くは予測された蛋白質への16S rRNA遺伝子類似性とBLASTマッチングに基づく深海環境から得られた環境配列に密接に関連している。DSC SAGは以前に他の生息地から得られたParcubacteriaで同定されたコード特徴なかった。これらは呼吸性硝酸還元に関連した酸化ストレス,多糖修飾と遺伝子への適応を含んでいる。DSC SAGはヌクレオチドとアミノ酸生合成,アルキル化DNAの修復および機械受容イオンチャンネルの合成のための遺伝子の相対的より大きな豊度によって区別もある。これらの結果は,Parcubacteriaの拡張された観点を示し,超深度超深海環境に存在するメンバーである。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,  生息場所 ,  深海 ,  ヌクレオチド ,  遺伝 ,  培養 ,  *ゲノム ,  系統発生 ,  酸化ストレス ,  クラスタ ,  グリコシル化 ,  類似性
準シソーラス用語： 16S rRNA ,  ニッチ ,  *マリアナ海溝 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (5件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  微生物の生態  (EG03040J) ,  環境因子の生物影響一般  (EE04010D) ,  海洋地質学  (DE06000F) ,  地質構造・テクトニクス  (DE04030Y)

タイトルに関連する用語 (4件)： マリアナ海溝 ,  単一細胞 ,  ゲノム ,  代謝