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J-GLOBAL ID：201702263931522482   整理番号：17A0891410

WebMolCS:三次元化学空間中に分子を可視化するためのウェブベースのインターフェース

WebMolCS: A Web-Based Interface for Visualizing Molecules in Three-Dimensional Chemical Spaces

著者 (3件)： AWALE Mahendra (Univ. Berne, Berne, CHE) ,  PROBST Daniel (Univ. Berne, Berne, CHE) ,  REYMOND Jean-Louis (Univ. Berne, Berne, CHE)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 57  号： 4  ページ： 643-649  発行年： 2017年04月 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 三次元(3D)化学空間において5000個までのユーザーが指定した分子を可視化できるウェブベースのインターフェースであるWebMolCSを開発した。WebMolCSは分子の組成,形状,ファルマコホアおよび下部構造を記述する多次元特性スペースに対して主成分解析と類似性マッピングを行うことで,6つの異なる3D化学空間を表示し,それらにおける分子の状態を可視化する。3D化学空間を生成するために,WebMolCSではフィンガープリントとして,1)形状に関して20D原子対フィンガープリント(APfp),2)組成に関して42D分子量子数(MQN)および34D SMILESフィンガープリント(SMIfp),3)ファルマコホアに関して55Dカテゴリー拡張原子対フィンガープリント(Xfp),および4)下部構造に関して1024D二成分下部構造フィンガープリント(Sfp)および1024D拡張連結性フィンガープリント(ECfp4)を用いた。各分子は色分けされた球体として表示され,それら球体毎に対応する分子構造および特性が関連付けされている。WebMolCSはhttp://www.gdb.unibe.chにて無料で利用できる。

シソーラス用語： データ ,  *可視化 ,  空間 ,  *システム ,  インタフェイス ,  *予測技法 ,  分子モデル ,  予測モデル ,  *主成分分析 ,  類似性 ,  *相似解 ,  フィンガープリント法 ,  窒素複素環化合物 ,  薬物 ,  タバコアルカロイド
準シソーラス用語： 三次元データ ,  *三次元可視化 ,  三次元空間 ,  *Webベースシステム ,  *ファルマコフォアマッピング ,  ファーマコホアモデル ,  多次元データ ,  *主成分解析 ,  分子類似性 ,  *類似性解析 ,  フィンガープリント解析

分類 (2件)： 薬物の研究法  (GV01020U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

物質索引 (1件)： ニコチン

タイトルに関連する用語 (5件)： 化学 ,  分子 ,  可視化 ,  ウェブ ,  インターフェース