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J-GLOBAL ID：201702264234792045   整理番号：17A0987338

蛋白質モデリングのためのADMA線形スケーリング法の「星状経路」増強の代替【Powered by NICT】

An alternative to the “Star Path” enhancement of the ADMA linear scaling method for protein modeling

著者 (3件)： Mezey Paul G. (Faculty of Chemistry and Chemical Engineering, Universitatea Babes-Bolyai, Str. Arany Janos nr 11, Cluj-Napoca, Romania, 400028) ,  Mezey Paul G. (Canada Research Chair in Scientific Modeling and Simulation, Department of Chemistry and Department of Physics and Physical Oceanography, Memorial University of Newfoundland, 283 Prince Philip Drive, St. John’s, Newfoundland and Labrador, A1B 3X7, Canada) ,  Antal Zoltan (Theoretical and Medical chemistry Research Division, Fundatia Provitam, Str. Caisului 16, Cluj-Napoca, RO, Cluj-Napoca, Cluj, Romania, 400487)
資料名： Journal of Computational Chemistry  (Journal of Computational Chemistry)
巻： 38  号： 20  ページ： 1774-1779  発行年： 2017年 
JST資料番号： C0111B  ISSN： 0192-8651  CODEN： JCCHDD  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 高分子量子化学立体配座解析と方法後の反応経路の性能を改善する目的で,調整可能な密度行列アセンブラ(ADMA)法は,ポテンシャルエネルギー面に沿ったいくつかの速かったが,精度の低い密度行列外挿法,Lowdin逆Lowdin(LIL)外挿などと結合しており,これらの方法の間の戦略的配置前後スイッチングは有利であることが証明されている。,代替方法を提案し,調べ,いくつかの実際の試験計算に基づいており,「安価な」LIL密度行列外挿ステップは幾分高価なが,ADMAベース計算のみによって置換される,「粗い探索段階」において,高分子内の短い距離の相互作用のみを考慮した。はこのアプローチは実現可能であり,ADMAとLILの両段階を含めた「星状経路」法の代替としてことを示した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 外挿法 ,  高分子 ,  密度行列 ,  *タンパク質 ,  スイッチング ,  量子化学 ,  アセンブラ ,  *モデリング ,  ポテンシャルエネルギー面 ,  *線形性 ,  相互作用 ,  反応経路
準シソーラス用語： 低価格 ,  立体配座解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ADMA ,  ab initio ,  蛋白質 ,  星経路 ,  Lowdin逆Lowdin ,  密度行列

分類 (2件)： 反応速度論・触媒一般  (CB06010G) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (9件)： 蛋白質 ,  モデリング ,  ADMA ,  線形 ,  スケーリング ,  星 ,  経路 ,  増強 ,  代替