文献

J-GLOBAL ID：201702264384153541   整理番号：17A1284086

ハイスループットシーケンシングに基づく短時系列生物データ圧縮研究【JST・京大機械翻訳】

RESEARCH ON DATA COMPRESSION OF SHORT-SEQUENCE BIOLOGICAL DATA BASED ON NEXT-GENERATION SEQUENCING

著者 (1件)： Meng Qian (復旦大学計算机科学技術学院 上海 200433)
資料名： Jisuanji Yingyong Yuruanjian  (Jisuanji Yingyong Yuruanjian)
巻： 34  号： 4  ページ： 22-27,98  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2940A  ISSN： 1000-386X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 高スループット配列決定技術(NGS)の発展は配列データ量の急速な増加をもたらし、データの貯蔵と転送に極めて大きな圧力をもたらした。データ圧縮技術はこの問題を解決する重要な方法である。従来の圧縮法はデータ自体の特性をうまく利用していない。そのため、計算機学者はNGSシークエンシングデータ専用の圧縮方法に注目している。高スループット配列決定技術により発生したFastqとFastaデータの圧縮アルゴリズムを全面的にまとめ、FastqとFastaデータの特徴を紹介し、現在常用されている圧縮方法をまとめた。また、異なる種、異なる配列のプラットフォーム、異なる規模の配列データを用いて、代表的な圧縮ツールに対してテストを行い、それらの圧縮性能を比較し、対応するツールの特徴を検証し、研究者にツール選択の指導を提供し、ツールの性能を改善するために役に立つ。最後に,短い配列データ圧縮ツールの問題と開発傾向についてまとめた。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 高速度 ,  *データ圧縮 ,  計算機科学 ,  アルゴリズム
準シソーラス用語： データ量 ,  *ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Data compression ,  Short-sequence data compression ,  Next-generation sequencing

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： 時系列 ,  生物 ,  データ圧縮 ,  研究