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J-GLOBAL ID：201702264739467567   整理番号：17A1501510

日本の飼育ブタから得られた新しい遺伝子型3E型肝炎ウイルス株の完全長ゲノム【Powered by NICT】

Full-length genome of a novel genotype 3 hepatitis E virus strain obtained from domestic pigs in Japan

著者 (12件)： Primadharsini Putu Prathiwi (Division of Virology, Department of Infection and Immunity, Jichi Medical University School of Medicine, 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke-Shi, Tochigi-Ken 329-0498, Japan) ,  Miyake Masao (Animal Biosecurity Consulting Inc., 3-25-29 Natsumidai, Funabashi-Shi, Chiba-Ken 273-0866, Japan) ,  Kunita Satoshi (Center for Experimental Medicine, Jichi Medical University School of Medicine, 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke-Shi, Tochigi-Ken 329-0498, Japan) ,  Nishizawa Tsutomu (Division of Virology, Department of Infection and Immunity, Jichi Medical University School of Medicine, 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke-Shi, Tochigi-Ken 329-0498, Japan) ,  Takahashi Masaharu (Division of Virology, Department of Infection and Immunity, Jichi Medical University School of Medicine, 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke-Shi, Tochigi-Ken 329-0498, Japan) ,  Nagashima Shigeo (Division of Virology, Department of Infection and Immunity, Jichi Medical University School of Medicine, 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke-Shi, Tochigi-Ken 329-0498, Japan) ,  Tanggis (Division of Virology, Department of Infection and Immunity, Jichi Medical University School of Medicine, 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke-Shi, Tochigi-Ken 329-0498, Japan) ,  Ohnishi Hiroshi (Division of Virology, Department of Infection and Immunity, Jichi Medical University School of Medicine, 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke-Shi, Tochigi-Ken 329-0498, Japan) ,  Kobayashi Tominari (Division of Virology, Department of Infection and Immunity, Jichi Medical University School of Medicine, 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke-Shi, Tochigi-Ken 329-0498, Japan) ,  Nishiyama Takashi (Division of Virology, Department of Infection and Immunity, Jichi Medical University School of Medicine, 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke-Shi, Tochigi-Ken 329-0498, Japan) ,  Jirintai Suljid (Division of Pathology, Department of Basic Veterinary Medicine, Inner Mongolia Agricultural University College of Veterinary Medicine, 306 Zhaowuda Rd, Saihan Qu, Hohhot, Inner Mongolia 010018, China) ,  Okamoto Hiroaki (Division of Virology, Department of Infection and Immunity, Jichi Medical University School of Medicine, 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke-Shi, Tochigi-Ken 329-0498, Japan)
資料名： Virus Research  (Virus Research)
巻： 240  ページ： 147-153  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0381D  ISSN： 0168-1702  CODEN： VIREDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： E型肝炎ウイルス(HEV)は,ヒトにおける急性または慢性肝炎を引き起こし,糞便 経口経路によって伝染できる。ブタはこの感染の主な貯水池の1つである。日本におけるブタ群の六十頭のブタ,4 5か月,検出可能な抗HEV IgG抗体を有しており,そのうちの五(8.3%)は遺伝子型3HEVの感染していた。ウイルス血症ブタから得られた五HEV株は98.8 100%のヌクレオチド同一性を共有し,一つの代表的歪(swHE1606845),その全ゲノム配列は本研究で決定した,そのサブタイプはまだ同定されていなかった他の遺伝子型3HEV株からサブタイプ3a 3kの報告されたHEV株と14.7 19.1%14.1 19.6%異なった。swHE1606845は他の遺伝子型3株割り当てられていないサブタイプのサブタイプ3a 3kと≧0.152の遺伝子型3HEV株と≧0.143の高いヌクレオチドp距離値を示した。SimPlot解析は組換事象の欠如を明らかにした。これらの結果は,swHE1606845は,遺伝子型3の新しい亜型の候補メンバーであることを示した。swHE1606845のような新規株を同定する試みは,この菌株の起源を明らかにし,新しいサブタイプを帰属するための二個の付加的なswHE1606845のような株の完全なヌクレオチド配列を決定するために実施される。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *ゲノム ,  貯水池 ,  ヌクレオチド ,  ヌクレオチド配列 ,  免疫グロブリンG ,  *日本 ,  ヒト ,  系統発生 ,  *遺伝子型 ,  慢性肝炎 ,  ウイルス血症
準シソーラス用語： 菌株 ,  サブタイプ ,  ゲノム配列 ,  *E型肝炎ウイルス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 完全ゲノム ,  家畜のブタ ,  E型肝炎ウイルス ,  新しいサブタイプ ,  系統発生解析

分類 (2件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  ウイルス学一般  (EG04010J)

タイトルに関連する用語 (6件)： 日本 ,  飼育 ,  ブタ ,  遺伝子型 ,  株 ,  ゲノム