キャニム肉牛における選択シグネチャ【JST・京大機械翻訳】

Ismael Urbinati; Nedenia Bonvino Stafuzza; Marcos Tulio Oliveira; Tatiane Cristina Seleguim Chud; Roberto Hiroshi Higa; Luciana Correia de Almeida Regitano; Mauricio Mello de Alencar; Marcos Eli Buzanskas; Danisio Prado Munari

文献

J-GLOBAL ID：201702265132868307 整理番号：17A1601948

キャニム肉牛における選択シグネチャ【JST・京大機械翻訳】

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資料名：
巻： 8 号： 1 ページ： 15-23 発行年： 2017年
JST資料番号： C2841A ISSN： 1674-9782 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：英語 (EN)

【背景】ゲノム学における最近の技術的進歩は,一塩基多型(SNP)パネルを通してウシの遺伝子タイピングを可能にした。高密度SNPパネルはより大きなゲノム被覆率を有し,選択シグネチャ(SS)として知られている選択によりゲノムの保存領域の同定に有用である。SSは,拡張したハプロタイプホモ接合性(EEH)のような異なる方法によって検出可能である。そして,統合されたハプロタイプスコア(IHS)は,EEHから導き出される。本研究の目的は,高密度SNPパネルによって遺伝子型化されたCanchim牛(複合品種)におけるSS領域を同定することであった。遺伝子型品質管理後のSS分析のために,【結果】Aの合計668,655のSNPマーカーと396のサンプルが残った。各マーカーに対するIHS統計量を,結果のより良い解釈のためにPIHSに変換した。染色体BTA5とBTA14は,それぞれ,39と9つの統計的に有意なSNPs(P-0.001)を有するPIHS-5を示した。候補選択領域に対して,IHS値をゲノム全体にわたり計算し,500Kbの非重複ウィンドウ内で平均化した。著者らは,代謝,メラニン生合成(色素沈着),および胚と骨の発達において重要な役割を果たす遺伝子を同定した。【結論】によると,SSの観察によると,Canchimで行われている選択プロセスは,特にBTA5とBTA14において,特定のゲノム領域を維持していることが示された.。これらの選択シグネチャ領域はCanchim特性化と関連していると考えられる。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

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牛 , 飼育動物の育種 , 遺伝子の構造と化学

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