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J-GLOBAL ID：201702265140215201   整理番号：17A1670333

5種のコイ科魚類リボソームITS1配列比較【JST・京大機械翻訳】

Comparative analysis of the first internal transcribed spacer of ribosomal DNA in five Soleidae species

著者 (5件)： Gong Li (广西科学院广西紅樹林研究中心,广西紅樹林保護与利用重点実験室,广西北海536000;中国科学院南海海洋研究所,熱帯海洋生物資源与生態重点実験室,广東广州510301;中国科学院大学,北京 100049) ,  Shi Wei (中国科学院南海海洋研究所,熱帯海洋生物資源与生態重点実験室,广東广州510301) ,  Yang Min (中国科学院南海海洋研究所,熱帯海洋生物資源与生態重点実験室,广東广州510301;中国科学院大学,北京 100049) ,  Si Lizhen (中国科学院南海海洋研究所,熱帯海洋生物資源与生態重点実験室,广東广州510301;中国科学院大学,北京 100049) ,  Kong Xiaoyu (中国科学院南海海洋研究所,熱帯海洋生物資源与生態重点実験室,广東广州510301)
資料名： Shuichan Xuebao  (Shuichan Xuebao)
巻： 41  号： 3  ページ： 321-329  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2171A  ISSN： 1000-0615  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： リボソーム遺伝子は長時間にわたり、共進化方式に厳格に従うと考えられているが、多くの種類において、明らかな配列多様性が発見され、それが非共進化であることが明らかになっている。本研究では,コイ科魚類におけるリボソームスペーサ1(ITS1)配列の多型性を検出し,種同定の分子マーカーとして用いることができるかどうかを調べるために,本研究において,5つの科魚類の合計18のITS1配列を得た。結果は,2つの顕著な断片型があることを示し,それはゲノムにおける非共進化に従うことを示した。しかし,他の4つの魚種においては,配列多様性は発見されず,それらは共進化であることが示された。配列分析により、ITS1は明らかな種間の長さの異質性があり、最も短い配列はガの条片にある(412 bp)、最も長いのは眼のヒキビラメ(585 bp)であることが明らかになった。塩基配列解析により,ITS1配列が5つの科の魚類において同じ傾向を示すことを示した。C>G>A>Tであり,GC含有量は69.5%であり,AT含有量よりはるかに高かった。クラスタ分析により、すべての種は単独で一つの分枝に属し、種の区別度は非常に顕著であり、ITS1配列は種の鑑定の分子マーカーとして利用できることが明らかになった。しかし、シジミの一つのクローンと東洋のポリジミは一つの分枝になり、この配列の多型は種の同定に干渉が生じ、多型のITS1配列を分子マーカーとする場合、必ず十分なクローン数があり、データが不十分であるため、不正確な結論を得ることができない。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ゲノム ,  ヌクレオチド配列 ,  クローン ,  *リボソーム ,  クラスタ分析 ,  *コイ科 ,  不均一性
準シソーラス用語： 配列解析 ,  魚種 ,  分子マーカー ,  種判別 ,  多型性 ,  共進化 ,  リボソーム遺伝子 ,  *ITS1 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Soleidae ,  internal transcribed spacer ,  species identification ,  molecular marker ,  pseudogene ,  non-concerted evolution ,  cluster analysis

分類 (1件)： 魚類  (FH02020K)

タイトルに関連する用語 (4件)： コイ科 ,  魚類 ,  リボソーム ,  ITS1