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J-GLOBAL ID：201702265484448720   整理番号：17A1249560

PepBio:宿主防御ペプチドの生物活性を予測する【Powered by NICT】

PepBio: predicting the bioactivity of host defense peptides

著者 (11件)： Simeon Saw (Center of Data Mining and Biomedical Informatics, Faculty of Medical Technology, Mahidol University, Bangkok 10700, Thailand. [e-mail]) ,  Li Hao ,  Win Thet Su ,  Malik Aijaz Ahmad ,  Kandhro Abdul Hafeez ,  Piacham Theeraphon ,  Shoombuatong Watshara ,  Nuchnoi Pornlada ,  Wikberg Jarl E. S. ,  Gleeson M. Paul ,  Nantasenamat Chanin
資料名： RSC Advances (Web)  (RSC Advances (Web))
巻： 7  号： 56  ページ： 35119-35134  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7055A  ISSN： 2046-2069  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 宿主防御ペプチド(HDP)は,広範囲の病原体の直接不活性化できるユビキタスと迅速応答免疫分子のクラスである。最近の研究は病原性微生物と悪性新生物の両方に対して有効であることを広域スペクトル化学療法薬の新規部類としての開発のための有望な候補であるとHDPを示した。本研究はそれぞれの生物活性を有するHDPの,解釈が容易なアミノ酸組成記述子との間の関係を定量的に検討することを目的とした。分類モデルはC4.5決定木とランダムフォレスト分類器を用いて構築した。全ての評価した三データサブセット(例えば訓練,10倍交差検証及び外部検証セット)の0.5以上の精度,90%以上の感度・特異度・Matthews相関係数から推定した達成した良好な予測性能。分類モデル構築のためのソースコードとデータセットでGitHubで利用可能である。Copyright 2017 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 病原体 ,  *ペプチド ,  ディシジョンツリー ,  不活性化 ,  相関係数 ,  アミノ酸組成 ,  *生物活性
準シソーラス用語： 予測性能 ,  特異度 ,  外部検証 ,  ランダムフォレスト ,  分類モデル ,  化学療法薬 ,  病原微生物 ,  *防衛 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  生理活性ペプチド  (EB08100U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 宿主 ,  防御 ,  ペプチド ,  生物活性 ,  予測