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J-GLOBAL ID:201702265904079912   整理番号:17A1629686

高速れん縮筋の比較トランスクリプトーム解析とトラフグTakifugu rubripesにおける遅い単収縮筋【Powered by NICT】

Comparative transcriptome analysis of fast twitch muscle and slow twitch muscle in Takifugu rubripes
著者 (9件):
資料名:
巻: 24  ページ: 79-88  発行年: 2017年 
JST資料番号: W2148A  ISSN: 1744-117X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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高速単収縮筋と遅いれん縮筋はTakifugu rubripesの二つの重要な器官である。両組織は外胚葉の起源であり,二筋線維間の差は,その筋原線維蛋白質組成と分子構造の違いを反映している。T.rubripesの二筋線維における遺伝子発現プロファイルを同定し,特性化するために,高速単収縮筋と遅い単収縮筋から五千四百万と四千四百万清浄リードを生成した,RNA-Seqを用い,両筋肉により発現された580速筋特異的遺伝子,1533遅筋特異的遺伝子,11,806個の遺伝子を同定した。速い単収縮及び遅い単収縮筋の比較トランスクリプトーム解析は1508の差次的に発現した遺伝子の同定,そのうちの34ミオシンと30ユビキチンファミリー遺伝子を決定したを可能にした。これらの差次的に発現した遺伝子(DEGs)もオントロジー(GO)解析とKyoto Encyclopediaof Genes and Genomes(KEGG)経路で解析した。添加では,選択的スプライシング分析も行った。本研究で提示した大規模なトランスクリプトームデータの発生はTakifugu rubripesの遺伝資源,筋肉の比較研究にも価値があろうを充実させる。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】
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