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J-GLOBAL ID：201702266660736011   整理番号：17A0483933

画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備 第2章 高次解析システムの整備 2 ゲノム情報を活用した新規遺伝子予測機能(3)プログラム運用

著者 (3件)： 伊藤剛 (農業生物資源研) ,  沼寿隆 (農業生物資源研) ,  田中剛 (農業生物資源研)
資料名： 農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果  (農林水産技術会議事務局研究成果)
号： 570  ページ： 23-24  発行年： 2017年03月31日 
JST資料番号： S0070A  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： GWAS及びゲノム構造変異の研究開発成果物である解析パイプラインについて,公開して運用した。一般ユーザーが容易に利用できる形態であることが必要なので,ウェブ上での操作を可能とするため,これまでに運用してきているGalaxyを活用した。(著者抄録)

シソーラス用語： 農作物 ,  *畜産物 ,  遺伝情報 ,  *データベース ,  計画 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  パイプライン ,  *運用 ,  *農産物 ,  ゲノム情報
準シソーラス用語： プログラム ,  GWAS

分類 (2件)： システム設計・解析  (IA02030D) ,  ドキュメンテーション  (FA01020I)

引用文献 (3件)：

• PLINK: Basic usage / data formats. http://pngu.mgh.harvard.edu/~purcell/plink/data.shtml (参照日 : 2016.7.11).
• Beagle. https://faculty.washington.edu/browning/beagle/beagle.html (参照日 : 2016.7. 11).
• qqman. https://cran.r-project.org/web/packages/qqman/vignettes/qqman.html ( 参照日 : 2016.7.11).

タイトルに関連する用語 (10件)： 畜産物 ,  ゲノム ,  情報データベース ,  整備 ,  解析システム ,  ゲノム情報 ,  活用 ,  遺伝子 ,  予測 ,  運用