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J-GLOBAL ID：201702267113295693   整理番号：17A1788943

オオタバコッカス菌による陸綿早期感染のトランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome Analysis of Verticillium dahliae in Upland Cotton at Early Infection Stage by RNA-seq

著者 (8件)： Zhang Zhidong (上海交通大学農業与生物学院,上海,200240) ,  Duan Xingpeng (上海交通大学農業与生物学院,上海,200240) ,  Zhou Yumei (上海交通大学農業与生物学院,上海,200240) ,  Li Jianfu (上海交通大学農業与生物学院,上海,200240) ,  Han Song (上海交通大学農業与生物学院,上海,200240) ,  Gao Zhengyin (上海交通大学農業与生物学院,上海,200240) ,  Zhao Jiawei (上海交通大学農業与生物学院,上海,200240) ,  Zuo Kaijing (上海交通大学農業与生物学院,上海,200240)
資料名： Mianhua Xuebao  (Mianhua Xuebao)
巻： 29  号： 3  ページ： 253-260  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2409A  ISSN： 1002-7807  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]本研究の目的は,トリコモナス属における病原性関連遺伝子のさらなる研究である。[方法]トランスクリプトームシークエンシング技術を用いて、強い病原性の大黄さび病菌Vd991が陸地綿品種Coker 312の早期段階に感染した遺伝子の発現状況を比較分析した。[結果]Vd991感染前後の転写データに対して差異発現分析を行い、979個の差異発現遺伝子(Differentially expressed protein,DEGs)をスクリーニングし、そのうち376個がアップレギュレーションし、603個がダウンレギュレーションした。遺伝子のアノテーションと機能分類により、これらのDEGsは細胞増殖と生長、胞子形成、炭水化物結合、蛋白質キナーゼ活性調節、解裂酵素活性、加水分解酵素活性などの機能に関わることが分かった。DEGsを上方制御する遺伝子オントロジー(Gene ontology,GO)の機能濃縮分析により、合計277個のGO見出し語が顕著な濃縮レベル(P<0.05)に達し、成長速度の正方向調節、ヌクレオチド合成、ヘリカーゼ活性などの機能に関与することが分かった。京都遺伝子とゲノム百科全書(Kyoto encyclopedia of growth and genomes,KEGG)の経路分析により、DEGsが53の代謝経路に参与し、ピリミジン代謝、プリン代謝などを含むことが明らかになった。【結論】初期の感染過程において,増殖に関連する遺伝子の発現は,活発なものによって活発化されることができることが示された。これらの結果は,更なる研究のための価値ある参照を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質キナーゼ ,  トリコモナス属 ,  病原性 ,  代謝 ,  *感染 ,  ゲノム ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  代謝経路 ,  胞子形成 ,  酵素活性度 ,  細胞増殖 ,  遺伝子 ,  ヒドロラーゼ
準シソーラス用語： *トランスクリプトーム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Verticillium dahliae ,  transcriptome analysis ,  cell proliferation ,  pathogenic mechanism

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 菌 ,  綿 ,  早期 ,  感染 ,  トランスクリプトーム解析