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J-GLOBAL ID：201702267268128018   整理番号：17A1172496

尿からDNAバイオマーカー抽出とPCR検出のためのマウス制御DNAの設計と使用:transrenal結核菌DNA検出への応用【Powered by NICT】

Design and use of mouse control DNA for DNA biomarker extraction and PCR detection from urine: Application for transrenal Mycobacterium tuberculosis DNA detection

著者 (20件)： Bordelon Hali (Department of Biomedical Engineering, Vanderbilt University, Nashville, TN, USA) ,  Ricks Keersten M. (Department of Chemistry, Vanderbilt University, Nashville, TN, USA) ,  Pask Megan E. (Department of Biomedical Engineering, Vanderbilt University, Nashville, TN, USA) ,  Russ Patricia K. (Department of Biomedical Engineering, Vanderbilt University, Nashville, TN, USA) ,  Solinas Francesca (Department of Biomedical Engineering, Vanderbilt University, Nashville, TN, USA) ,  Baglia Mark L. (Department of Biomedical Engineering, Vanderbilt University, Nashville, TN, USA) ,  Short Philip A. (Department of Biomedical Engineering, Vanderbilt University, Nashville, TN, USA) ,  Nel Andrew (Institute of Infectious Disease and Molecular Medicine, Department of Integrative Biomedical Sciences, University of Cape Town, Cape Town, South Africa) ,  Blackburn Jonathan (Institute of Infectious Disease and Molecular Medicine, Department of Integrative Biomedical Sciences, University of Cape Town, Cape Town, South Africa) ,  Blackburn Jonathan (Tuberculosis Center, Department of Medicine, Division of Infectious Diseases and Institute for Global Health, Vanderbilt University School of Medicine, Nashville, TN, USA) ,  Dheda Keertan (Lung Infection and Immunity Unit, University of Cape Town, Cape Town, South Africa) ,  Zamudio Carlos (de Medicina Tropical Alexander von Humboldt, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Peru) ,  Caceres Tatiana (de Medicina Tropical Alexander von Humboldt, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Peru) ,  Wright David W. (Department of Chemistry, Vanderbilt University, Nashville, TN, USA) ,  Wright David W. (Tuberculosis Center, Department of Medicine, Division of Infectious Diseases and Institute for Global Health, Vanderbilt University School of Medicine, Nashville, TN, USA) ,  Haselton Frederick R. (Department of Biomedical Engineering, Vanderbilt University, Nashville, TN, USA) ,  Haselton Frederick R. (Department of Chemistry, Vanderbilt University, Nashville, TN, USA) ,  Haselton Frederick R. (Tuberculosis Center, Department of Medicine, Division of Infectious Diseases and Institute for Global Health, Vanderbilt University School of Medicine, Nashville, TN, USA) ,  Pettit April C. (Division of Infectious Diseases, Department of Medicine, Vanderbilt University School of Medicine, Nashville, TN, USA) ,  Pettit April C. (Tuberculosis Center, Department of Medicine, Division of Infectious Diseases and Institute for Global Health, Vanderbilt University School of Medicine, Nashville, TN, USA)
資料名： Journal of Microbiological Methods  (Journal of Microbiological Methods)
巻： 136  ページ： 65-70  発行年： 2017年 
JST資料番号： H0882A  ISSN： 0167-7012  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 尿試料は,Escherichia coli,エボラウイルスおよびジカウイルスを含む感染症を診断するための使用が増加している。しかし,尿からの核酸バイオマーカーの抽出と濃縮は,ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)のような多くの分子検出法が必要である。尿試料は典型的には希薄バイオマーカー濃度,偽陰性を起こさせ易くして大容量を持っているので,尿診断のためのもう一つの障害は,適切な制御の確立特に偽陰性を除外することである。本研究では,マウスグリセルアルデヒド3-りん酸デヒドロゲナーゼ(GAPDH)DNA標的は無傷DNAの抽出と尿試料からのPCR阻害物質の除去を示す結核(TB)感染とTB非感染患者から遡及的に収集した尿試料に添加した。代用尿試料にこの設計を試験した,南アフリカ,ケープタウンにおける患者からのペルー,リマと遡及的5mLの尿試料中の患者からretrospective1milliliter(mL)尿試料。抽出/PCR対照DNAは,群間で統計的有意差を用いた臨床試料の97%では検出されなかった。この制御の介在物にもかかわらず,Tr DNAは,既知のHIV感染患者からの試料を除いてTB感染とTB非感染群間で検出されなかったTB IS6110の量の差はなかった。TB uninfected/HIV感染患者(N=18, p=0.037)と比較してTB/HIV同時感染患者間の結核IS6110Tr DNAの増加を見出した。PCR阻害物質の成功したDNA抽出と除去を示すために抽出/PCR対照DNAの包接は他の無細胞試料タイプのための試料調製対照として容易に適応すべきである。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *結核菌 ,  *DNA【核酸】 ,  南アフリカ共和国 ,  大腸菌 ,  HIV感染症 ,  *結核 ,  *バイオマーカー ,  試料調製 ,  HIV【ウイルス】 ,  感染 ,  *PCR法 ,  患者
準シソーラス用語： DNA抽出 ,  阻害剤 ,  偽陰性 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  微生物検査  (GC02030H)

タイトルに関連する用語 (8件)： 尿 ,  DNA ,  バイオマーカー ,  PCR検出 ,  マウス ,  設計 ,  結核菌 ,  応用