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J-GLOBAL ID：201702267589051190   整理番号：17A1670091

低温ストレス下における馬鈴薯のデジタル遺伝子発現プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Digital Gene Expression Profiling Analysis of Potato under Low Temperature Stress

著者 (2件)： Yang Huiju (云南農業大学農学与生物技術学院薯類作物研究所,云南昆明,650201) ,  Guo Huachun (云南農業大学農学与生物技術学院薯類作物研究所,云南昆明,650201)
資料名： Zuowu Xuebao  (Zuowu Xuebao)
巻： 43  号： 3  ページ： 454-463  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2128A  ISSN： 0496-3490  CODEN： TSHPA9  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ジャガイモ品種の協力88を材料とし、デジタル遺伝子発現スペクトル(DGE)技術を用いて、-2°Cの低温ストレス処理後のジャガイモ葉身cDNAライブラリーに対して差異遺伝子発現スペクトル分析を行った。結果により、28505個の遺伝子が低温ストレスにより誘導され、発現遺伝子が13703個発現し、遺伝子発現が14802個低下し、GOの機能が顕著に濃縮されたことが明らかになった。DEGsは主に生物の代謝過程、酸化還元過程、エネルギー代謝、二次代謝過程及び触媒活性に関わっているが、KEGGの濃縮分析により、以下のことが明らかになった。アップレギュレーション遺伝子は主にフェニルプロパノイド、光合成アンテナ蛋白質、カロチノイドの生合成、フェニルアラニン代謝及びデンプンとショ糖代謝経路に集中し、ダウンレギュレーション遺伝子は主に植物ホルモンシグナル伝達経路に富む。リアルタイム蛍光定量PCR(qRT-PCR)を用いて、4つのDEGsが低温ストレス条件下での差異発現を検証し、その結果はDGE分析結果とほぼ一致し、DGE配列決定結果の信頼性を実証した。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ダウンレギュレーション ,  *寒冷ストレス ,  アップレギュレーション ,  酸化還元反応 ,  植物ホルモン ,  タンパク質 ,  澱粉 ,  分光分析 ,  カロチノイド ,  触媒活性 ,  *ジャガイモ ,  光合成 ,  *遺伝子 ,  *遺伝子発現
準シソーラス用語： フェニルプロパノイド , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Potato ,  Low temperature stress ,  Gene expression profile ,  Differentially expressed genes

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： 低温ストレス ,  馬鈴薯 ,  デジタル ,  遺伝子発現プロファイリング