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J-GLOBAL ID：201702267741375417   整理番号：17A1464404

慢性肝疾患の食事療法に対する分枝鎖アミノ酸を強化した治療蛋白質のin silico設計【Powered by NICT】

In silico designing of therapeutic protein enriched with branched-chain amino acids for the dietary treatment of chronic liver disease

著者 (2件)： L. Sunil (Department of Food Safety and Analytical Quality Control Laboratory, CSIR-Central Food Technological Research Institute, Mysuru, 570020, Karnataka, India) ,  Vasu Prasanna (Department of Food Safety and Analytical Quality Control Laboratory, CSIR-Central Food Technological Research Institute, Mysuru, 570020, Karnataka, India)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 76  ページ： 192-204  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ロイシン,イソロイシン,及びバリンは40 45%の全必須アミノ酸の三種類の分枝鎖アミノ酸(BCAA)を考慮した。BCAAは骨格筋で主に蛋白質合成を刺激し,それは肝臓をバイパスする循環血流への輸送できる。BCAAと濃縮された蛋白質は慢性肝疾患の食事療法のための重要な治療標的である。本研究では,BCAAを強化した合成蛋白質を設計することであると挑戦はBCAA含有量を最大化し,WHO/UNU/FAOにより規定されたロイシン,イソロイシン,バリン 2:1:1.2の平衡比を維持することである。,ホモロジーモデリングの一般的な概念を変化させ過剰BCAA量を増加した安定性および消化性に好適な足場(α-ヘリックス)を見出すことを試みた。合計50蛋白質モデルのSWISS-MODEL,モデラー9.17ProtParamツール,アレルゲンオンラインツールを用いて構築した。50異なる蛋白質モデルのうち,蛋白質モデル50が最良であることが分かり,これは明確な3D構造,良好なin silico消化性,BCAAの平衡比を有し,テンプレートアポウシα-ラクトアルブミン(1F6R)~65.57%構造同一性を示した。テンプレート探索は,PSI-BLAST,SWISS-MODEL,PROFUNC,I TASSER,保存表面マッピングを用いたPDBに対して行った。二次構造はPSSPred,PSIPRED,I TASSER,(ビール),SPIDER2により予測した。蛋白質モデル50のモデル構造は,PROCHECK,ERRAT,ProSA,とQMEANにより検証した。COACHとProFUNCツールは蛋白質モデル50の機能的効果を決定するために実施した。全体として,BCAAはLeu-Ile-Val(2:1:1.2)の平衡比を22から56.4%まで濃縮された。RamachandranプロットはERRATスコア86.05の許容領域におけるアミノ酸残基の97.7%を示した。高評判計算ツールを用いた標的蛋白質モデル50の完全な三次元構造をモデル化することに成功した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *分枝鎖アミノ酸 ,  三次元 ,  骨格筋 ,  モデリング ,  タンパク質合成 ,  *タンパク質 ,  アミノ酸残基 ,  *食事療法 ,  二次構造 ,  消化性 ,  必須アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： *in silico , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 分枝鎖アミノ酸(BCAA) ,  ホモロジーモデリング ,  アポウシα-ラクトアルブミン ,  二次構造予測 ,  3次元構造予測 ,  蛋白質検証

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  分子化合物  (CE02000C)

物質索引 (3件)： バリン ,  イソロイシン ,  ロイシン

タイトルに関連する用語 (7件)： 慢性肝疾患 ,  食事療法 ,  分枝鎖アミノ酸 ,  強化 ,  治療 ,  蛋白質 ,  設計