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J-GLOBAL ID：201702267919929803   整理番号：17A1097511

結核菌と全ゲノム配列決定:実践的なガイドと臨床微生物学者のための利用可能なオンラインツール【Powered by NICT】

Mycobacterium tuberculosis and whole genome sequencing: a practical guide and online tools available for the clinical microbiologist

著者 (4件)： Satta G. (Centre for Clinical Microbiology, Department of Infection, University College London, UK) ,  Satta G. (Imperial College Healthcare NHS Trust, London, UK) ,  Atzeni A. (Centre for Clinical Microbiology, Department of Infection, University College London, UK) ,  McHugh T.D. (Centre for Clinical Microbiology, Department of Infection, University College London, UK)
資料名： Clinical Microbiology and Infection  (Clinical Microbiology and Infection)
巻： 23  号： 2  ページ： 69-72  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3155A  ISSN： 1198-743X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 全ゲノムシークエンシング(WGS)はMycobacterium tuberculosis(結核菌)感染の診断に革命をもたらす可能性を持っているが,臨床微生物学者間の生物情報学的専門知識の欠如は,採用の障壁である。解析のためのソフトウェア製品は簡単で,電荷の自由,シーケンサ(FASTQファイル)から直接データを受容すると塩基性官能基オールインワンを提供すべきである。叙述的レビューの主な目的は,臨床微生物学者のための実用的なガイドを提供し,ほとんどまたはWGS分析の実際の経験と,M.tuberculosis分析のための,テーラーメードのソフトウェア製品に注目することである。外部プロバイダによる配列決定により,微生物学研究室の日常的臨床診療におけるWGS分析を実装し,従来の表現型培養法前抵抗週間を検出する可能性を現在可能であるが,臨床微生物学者はこの手法の限界を認識すべきである。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 塩基性 ,  Mycobacterium ,  *微生物学 ,  ソフトウェア商品 ,  *結核菌 ,  感染 ,  電荷 ,  表現型 ,  培養
準シソーラス用語： 官能基 ,  シーケンサ ,  バイオインフォマティクス ,  *臨床微生物学 ,  *ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Mycobacterium tuberculosis ,  系統発生解析 ,  オンラインツール ,  迅速感受性試験 ,  全ゲノム配列決定

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 結核菌 ,  ゲノム配列 ,  臨床微生物学 ,  オンライン ,  ツール