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J-GLOBAL ID：201702268193734978   整理番号：17A0521731

ワタ:ワタの栽培化におけるサブゲノムの非対称選択とcis調節の分岐

Asymmetric subgenome selection and cis-regulatory divergence during cotton domestication

著者 (24件)： WANG Maojun (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  TU Lili (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  LIN Min (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  LIN Zhongxu (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  WANG Pengcheng (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  YANG Qingyong (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  YE Zhengxiu (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  SHEN Chao (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  LI Jianying (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  ZHANG Lin (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  ZHOU Xiaolin (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  LI Zhonghua (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  GUO Kai (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  MA Yizan (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  HUANG Cong (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  JIN Shuangxia (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  ZHU Longfu (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  ZHANG Qinghua (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  ZHANG Xianlong (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  NIE Xinhui (Shihezi Univ., Shihezi, CHN) ,  YANG Xiyan (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  MIN Ling (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  YUAN Daojun (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  LINDSEY Keith (Durham Univ., Durham, GBR)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 49  号： 4  ページ： 579-587  発行年： 2017年04月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 比較集団ゲノム学は,作物の栽培化における遺伝学的な歴史を解き明かす優れた手段となる。リクチワタ(Gossypium hirsutum)は経済的に重要な作物であるが,人為選択の影響に関するゲノムワイドかつ進化学的理解は不足している。本論文では,352の野生種および栽培種ワタのアクセッション品種を対象にしたゲノム多様性地図について述べる。栽培化による一掃(sweep)を受けたゲノム領域として93の領域を同定し(Aサブゲノムの74MbとDサブゲノムの104Mb),ゲノム関連解析により,綿繊維の質に関わる形質と関連する19の候補座位を同定した。そして,綿花の繊維が長いという方向性選択が起こるときには,栽培化の過程でサブゲノム間に非対称な選択が生じている証拠を示した。また,DNaseI高感受性部位の網羅的解析および3Dゲノム構造の解析を行い,機能性バリアントと遺伝子転写とを関連づけ,栽培化がcis調節配列の分岐に及ぼす影響を明らかにした。本研究成果は,主要な農作物における遺伝子の構成,調節,適応についての新たな手掛かりを与えるものであり,また,ゲノムを利用したワタの品種改良のための豊かな情報源となるものである。Copyright Nature Japan KK 2017

シソーラス用語： *ワタ ,  栽培品種 ,  野生生物 ,  *作物育種 ,  *ゲノム ,  生物多様性 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  綿 ,  遺伝子 ,  非対称性 ,  DNアーゼ ,  エンドヌクレアーゼ ,  *突然変異体 ,  *育種 ,  選択 ,  クロマチン
準シソーラス用語： *Gossypium hirsutum ,  野生種 ,  *栽培化 ,  綿繊維 ,  候補遺伝子 ,  DNアーゼ1 ,  *品種改良

分類 (3件)： 繊維料作物  (FC03077U) ,  植物の生化学  (EH01050J) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (8件)： ワタ ,  栽培化 ,  サブ ,  ゲノム ,  非対称 ,  CIS ,  調節 ,  分岐