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文献
J-GLOBAL ID:201702268430174801   整理番号:17A0361533

新しい単一ヌクレオチド多型に基づくポリメラーゼ連鎖反応を用いたカナダの乳牛群における4種の主要な歪型のMycobacterium avium ssp.paratuberculosisの相対頻度【Powered by NICT】

Relative frequency of 4 major strain types of Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis in Canadian dairy herds using a novel single nucleotide polymorphism-based polymerase chain reaction
著者 (3件):
資料名:
巻: 99  号: 10  ページ: 8297-8303  発行年: 2016年
JST資料番号: C0282A  ISSN: 0022-0302  CODEN: JDSCAE  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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ヨーネ病は世界的な関心事である,膨大な経済的損失を引き起こす。病原体,Mycobacterium avium ssp.paratuberculosis(MAP)は,限られた遺伝的多様性を持ち,歪タイプの透過と分布を理解するための努力を妨害する。全ゲノム塩基配列決定は,以前にカナダの酪農群からのMAP分離株の代表的なセットについて行い,9分岐クレードを同定した。四クレードは特に興味があった,北アメリカで報告されているほとんどのいずれかMAPタイプ,またはそれらがカナダの酪農場から回収された分離株のかなりの割合を示した。一つのクレードはI/III型分離株を含んでいたが,残されたクレードはII型分離株を含んでいた。MAPゲノムにおける変異部位はしばしば千塩基対によって分離された,単一ゲノム領域の単一ヌクレオチド多型(SNP)に基づくゲノタイピングの使用を制限している。SNP PCR法はゲノムの二つの離れた領域における5SNPの検査を容易にするために開発,その後のSanger配列決定のための単一PCR反応においてそれらを結合した。このハイスループットアッセイは,264群(地域10)から602MAP分離株の識別を可能にした。1以上の分離株は133の牛群から培養した,そのうちの14は複数のサブタイプを含んでいた。以前に同定された支配的な型は,分離株の87%を含んでいたが,バイソン型は以前に報告されたより多かった。関心の第二クレードから後者と分離株はケベック州とサスカチュワン州において過剰発現した。結論として,カナダの酪農群内のMAPサブタイプの分布と相対頻度は新しいSNPタイピングアッセイを用いて評価した。これらの知見は,この集団と他のMAPの臨床的関連性と透過動力学の理解に寄与するであろう。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】
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, 【Automatic Indexing@JST】
分類 (2件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
細菌による動物の伝染病  ,  牛 

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