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J-GLOBAL ID：201702268630819478   整理番号：17A1189688

臨床使用のためのヒトTRBレパートリーの次世代シークエンシングの適用における方法論的考察【Powered by NICT】

Methodologic Considerations in the Application of Next-Generation Sequencing of Human TRB Repertoires for Clinical Use

著者 (8件)： Xu Liwen (Department of Pathology, Stanford School of Medicine, Stanford University, Stanford, California) ,  You Xiaoqing (Department of Pathology, Stanford School of Medicine, Stanford University, Stanford, California) ,  Zheng PingPing (Division of Blood and Marrow Transplantation, Department of Medicine, Stanford School of Medicine, Stanford University, Stanford, California) ,  Zhang Bing M. (Department of Pathology, Stanford School of Medicine, Stanford University, Stanford, California) ,  Gupta Puja K. (Division of Blood and Marrow Transplantation, Department of Medicine, Stanford School of Medicine, Stanford University, Stanford, California) ,  Lavori Philip (Department of Biomedical Data Science, Stanford School of Medicine, Stanford University, Stanford, California) ,  Meyer Everett (Division of Blood and Marrow Transplantation, Department of Medicine, Stanford School of Medicine, Stanford University, Stanford, California) ,  Zehnder James L. (Department of Pathology, Stanford School of Medicine, Stanford University, Stanford, California)
資料名： Journal of Molecular Diagnostics  (Journal of Molecular Diagnostics)
巻： 19  号： 1  ページ： 72-83  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3144A  ISSN： 1525-1578  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 免疫受容体の次世代シークエンシング(NGS)はリンパ系悪性腫瘍の治療を受けた患者における微小残存病変(MRD)を評価するために標準的なツールとなっており,多くの臨床設定におけるT細胞レパートリーを研究するために使用されている。MRDの外この応用の可能性臨床的有用性と限界をより良く理解するために,著者らはBIOMED 2プライマーに基づくNGS法を開発し,同種造血移植後の移植片対宿主病(GVHD)患者と健常者とでその性能を評価した。GVHD患者と健常者とでは,同じT細胞受容体β(TRB)ライブラリーの反復配列は高度に再現性があった。同じDNA株から作られた種々のTRBライブラリーの配列決定で観察された高い変動性。変動性は,対照と比較してGVHD患者における増加した;GVHD患者は対照よりも低い多様性を示した。健常者のT細胞レパートリーでは,CDR3クローンの約99.6%は低量で,周波数<10~ 3であった。単一ライブラリーはレパートリーにおける周波数≧10~ 3クローンの>93%を同定することができた。二重配列決定は平均検出率を増加させた>97%であった。NGSは周波数≧10~ 3のGVHDを健常人と患者におけるTRB集団を特徴付ける信頼性高く強固とMRDを超えた臨床試験応用NGS免疫レパートリー法を適用するための方法論的枠組みを提供することを示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 移植片対宿主病 ,  DNA【核酸】 ,  T細胞 ,  *ヒト ,  クローン ,  信頼性 ,  T細胞受容体 ,  患者 ,  臨床試験 ,  再現性 ,  周波数
準シソーラス用語： 健常者 ,  微小残存病変 ,  悪性腫瘍 ,  *次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 腫ようの診断  (GE03020J) ,  免疫性疾患・アレルギー性疾患の治療  (GD04030Y) ,  血液の腫よう  (GK04000M) ,  免疫性疾患・アレルギー性疾患一般  (GD04010C)

タイトルに関連する用語 (4件)： 臨床 ,  ヒト ,  次世代シークエンシング ,  方法論