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J-GLOBAL ID：201702268864763121   整理番号：17A0988345

ゴーストの追跡:その唯一の二倍体同族体と未知の祖先からOxyria sinensis(タデ科)の異質倍数体起源【Powered by NICT】

Chasing ghosts: allopolyploid origin of Oxyria sinensis (Polygonaceae) from its only diploid congener and an unknown ancestor

著者 (10件)： Luo Xin (MOE Key Laboratory for Bio-resources and Eco-environment, College of Life Science, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Hu Quanjun (MOE Key Laboratory for Bio-resources and Eco-environment, College of Life Science, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Hu Quanjun (State Key Laboratory of Grassland Agro-Ecosystem, College of Life Science, Lanzhou University, Lanzhou, China) ,  Zhou Pingping (MOE Key Laboratory for Bio-resources and Eco-environment, College of Life Science, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Zhang Dan (MOE Key Laboratory for Bio-resources and Eco-environment, College of Life Science, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Wang Qian (MOE Key Laboratory for Bio-resources and Eco-environment, College of Life Science, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Wang Qian (Research Center for Medicine and Biology, Zunyi Medical University, Zunyi, China) ,  Abbott Richard J. (School of Biology, University of St Andrews, St Andrews, Fife, KY16 9TH, UK) ,  Liu Jianquan (MOE Key Laboratory for Bio-resources and Eco-environment, College of Life Science, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Liu Jianquan (State Key Laboratory of Grassland Agro-Ecosystem, College of Life Science, Lanzhou University, Lanzhou, China)
資料名： Molecular Ecology  (Molecular Ecology)
巻： 26  号： 11  ページ： 3037-3049  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2684A  ISSN： 0962-1083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 祖先は絶滅したとき倍数種の起源の再構成は特に困難である。このような状況下で,倍数体に見られるゲノムの絶滅したドナーは,その前の存在は倍数体におけるゲノムの存在により認識されている「ゴースト」種として扱われる。本研究では,唯一の同属種が知られているOxyria sinensis(2n=40)の倍数体起源,二倍体であるO.digyna(2n=14)を決定することを目的とした。ゲノムin situハイブリダイゼーション(GISH),トランスクリプトーム,系統発生学的および人口統計学的解析,および生態学的ニッチモデリングは,この目的のために実施した。GISH(ゲノムin situハイブリダイゼーションは,O.sinensisは未知祖先からO.digynaおよび26染色体からの14染色体から成ることを明らかにした。トランスクリプトーム解析は,O.digynaから発散,一千二百万年前にゲノム重複(Ma)を含む後,第二ゲノム重複は約6Maに生じたO.sinensisを生じることを示した。Oxyria sinensisはO.digynaのそれらとクラスター集合に加えてO.digynaに存在するものから分岐した相同遺伝子配列を含むことが示された。合体シミュレーションは,O.sinensisは約6 7Maその分布を拡大し,第二の倍数化イベントに続くが,O.digynaはずっと後にその範囲を拡大したことを示した。も両種の分布を発症し,更新世の気候振動中の入っことが示唆された。生態学的ニッチモデリングは同様に両種は第四紀気候変化に応答してそれらの分布範囲の変化を経験したことを示唆した。,発生するO.sinensisの起源に関与する未知の「ゴースト」四倍体種の絶滅は,領域の反復気候変化へのO.sinensisの優れた適応から起因したはずである。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *ゴースト ,  四倍体 ,  シミュレーション ,  統計解析 ,  気候 ,  遺伝子重複 ,  *二倍体 ,  生態学 ,  *倍数体 ,  クラスタ ,  トランスクリプトーム ,  ゲノム ,  気候変動
準シソーラス用語： GISH法 ,  *異質倍数体 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 異質倍数性種分化 ,  個体群統計学的歴史 ,  ゴースト種 ,  GISH ,  Oxyria ,  トランスクリプトーム

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (7件)： ゴースト ,  追跡 ,  二倍体 ,  同族体 ,  タデ科 ,  異質倍数体 ,  起源