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J-GLOBAL ID：201702269069123460   整理番号：17A1560145

ケモインフォマティクス構造ベースの設計に向けて:NAOMIライブラリーに基づくWebサービスおよびデスクトップへの応用【Powered by NICT】

From cheminformatics to structure-based design: Web services and desktop applications based on the NAOMI library

著者 (14件)： Bietz Stefan (Universitaet Hamburg, ZBH - Center for Bioinformatics, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany) ,  Inhester Therese (Universitaet Hamburg, ZBH - Center for Bioinformatics, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany) ,  Lauck Florian (Universitaet Hamburg, ZBH - Center for Bioinformatics, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany) ,  Sommer Kai (Universitaet Hamburg, ZBH - Center for Bioinformatics, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany) ,  von Behren Mathias M. (Universitaet Hamburg, ZBH - Center for Bioinformatics, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany) ,  Faehrrolfes Rainer (Universitaet Hamburg, ZBH - Center for Bioinformatics, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany) ,  Flachsenberg Florian (Universitaet Hamburg, ZBH - Center for Bioinformatics, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany) ,  Meyder Agnes (Universitaet Hamburg, ZBH - Center for Bioinformatics, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany) ,  Nittinger Eva (Universitaet Hamburg, ZBH - Center for Bioinformatics, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany) ,  Otto Thomas (Universitaet Hamburg, ZBH - Center for Bioinformatics, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany) ,  Hilbig Matthias (Universitaet Hamburg, ZBH - Center for Bioinformatics, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany) ,  Schomburg Karen T. (Universitaet Hamburg, ZBH - Center for Bioinformatics, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany) ,  Volkamer Andrea (Institute of Physiology, Charite - Universitaetsmedizin Berlin, Virchowweg 6, 10117 Berlin, Germany) ,  Rarey Matthias (Universitaet Hamburg, ZBH - Center for Bioinformatics, Bundesstrasse 43, 20146 Hamburg, Germany)
資料名： Journal of Biotechnology  (Journal of Biotechnology)
巻： 261  ページ： 207-214  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0456C  ISSN： 0168-1656  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 今日,計算論的アプローチは,生命科学研究に不可欠な部分である。実験結果,データ解析,可視化タスクの解釈に関連する問題をディジタル時代の成果から利益を得る。シミュレーション法は,物理化学的性質の予測を容易にし,巨大分子現象の解明を助けることができる。ここでは,全ての生命科学分野の研究者を支援することを目指していることを著者らのグループで開発された方法の概観を与えるであろう。構造バイオインフォマティクスとケモインフォマティクスから最新の手法に基づいて,広い範囲の研究課題をカバーするソフトウェアを提供した。オールインワンWebサービスプラットフォームProteinsPlus(http://proteins.plus)はモデルのポケット部とドラッガビリティ予測,水素配置,構造品質評価,アンサンブル発生,蛋白質-蛋白質相互作用分類,および2D相互作用可視化のための解を提供する。さらに,ファイルフォーマット変換,分子データ集合処理,SMARTS編集,フラグメント空間計数,および配位子に基づく仮想スクリーニングのようなケモインフォマティクス問題を標的としたツールを含むソフトウェアパッケージを提供した。さらに,構造ライブラリーを横切る逆スクリーニング,結合部位整列及び探索相互作用パターンのための構造バイオインフォマティクス解を含んでいる。ソフトウェアパッケージであるhttp://software.zbh.uni hamburg.deで利用可能である。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： アラインメント ,  可視化 ,  プログラムパッケージ ,  計算理論 ,  予測 ,  スクリーニング ,  相互作用 ,  ライフサイエンス ,  シミュレーション ,  *Webサービス ,  結合部位 ,  データ解析
準シソーラス用語： 品質評価 ,  バイオインフォマティクス ,  *ケモインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： ケモインフォマティクス ,  構造に基づいた設計 ,  ProteinsPlus ,  NAOMI

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： ケモインフォマティクス ,  設計 ,  ライブラリー ,  Webサービス ,  デスク ,  トップ ,  応用