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J-GLOBAL ID：201702269342229794   整理番号：17A0705650

病原因子活性相関(VFARs):バイオインフォマティクスにおける展望【Powered by NICT】

Virulence factor activity relationships (VFARs): a bioinformatics perspective

著者 (8件)： Waseem Hassan (Department of Civil and Environmental Engineering, Michigan State University, East Lansing, MI 48824, USA. [e-mail]) ,  Williams Maggie R. ,  Stedtfeld Tiffany ,  Chai Benli ,  Stedtfeld Robert D. ,  Cole James R. ,  Tiedje James M. ,  Hashsham Syed A.
資料名： Environmental Science: Processes & Impacts  (Environmental Science: Processes & Impacts)
巻： 19  号： 3  ページ： 247-260  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1160A  ISSN： 2050-7887  CODEN： ESPICZ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 病原因子活性相関(VFARs)-化学物質の定量的構造活性相関(QSARs)をベースにしたゆるく概念は水の安全性に関連した微生物によるランキングリスクのための予測ツールとして提案した。配列決定能力とバイオインフォマティクスツールの急速な増加がVFARベース分析の可能性を有意に増加させた。本レビューでは,20以上の生物情報学データベースとツール,過去10年間に開発されて,それらの病原性と抗菌剤耐性予測能力を要約した。13000を超える241000とメタゲノム解析プロジェクトと数百ドルの追加的ゲノム配列を付加する能力を超える細菌全ゲノム配列の数により,VFARsのさらなる開発は,少なくともゲノムレベルでの情報の利用可能性によって制限されないことは明らかである。しかし,共起,治療反応,環境および他の因子による病原性の調節,および経済的影響に関連する付加的な情報は,関連する不確実性を解決するような方法で集め,組み込まれなければならない。バイオインフォマティクスツールのうち,病原性/抵抗決定専用に設計されたまたは専用モジュールを備えたのいずれかである大部分。残りは病原性を評価するために採用できる可能性がある。オミクス技術とツールに広く焦点を当てて本レビューでは,これらのツールは,与えられたニッチへの重要な生物をランク付けし,優先順位付けするための付加的エンジニアリングと経済的分析と組み合わせたVFARアプローチの応用可能にするために開発があるという概念を支持する。知識ギャップは存在するが10年前に想像した集束実験と理論解析で満たされている。電流能力を改善するための活性,リスクと不確実性の測定の統合考慮しなければならない更なる発展。Copyright 2017 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 不確実性 ,  抗細菌薬 ,  定量的構造活性相関 ,  経済分析 ,  細菌 ,  安全性 ,  データベース ,  経済効果 ,  *病原性 ,  等級づけ ,  予測
準シソーラス用語： オミックス ,  ゲノム配列 ,  *バイオインフォマティクス ,  *病原因子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 重金属とその化合物一般  (SB05021R) ,  その他の汚染原因物質  (SB05040W) ,  人間に対する影響  (EE05050C)

タイトルに関連する用語 (5件)： 病原因子 ,  活性 ,  相関 ,  バイオインフォマティクス ,  展望