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J-GLOBAL ID：201702270334012191   整理番号：17A1209262

点突然変異と未成熟終止誤差の存在下でのRNA複製にとっての誤差閾値【Powered by NICT】

Error thresholds for RNA replication in the presence of both point mutations and premature termination errors

著者 (2件)： Tupper Andrew S (Department of Biochemistry and Department of Physics and Astronomy, McMaster University, Hamilton, Ontario, Canada) ,  Higgs Paul G (Department of Biochemistry and Department of Physics and Astronomy, McMaster University, Hamilton, Ontario, Canada)
資料名： Journal of Theoretical Biology  (Journal of Theoretical Biology)
巻： 428  ページ： 34-42  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0288B  ISSN： 0022-5193  CODEN： JTBIA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ポリメラーゼリボザイムをテンプレートとして隣接鎖を使用RNAワールドにおける複製の空間モデルを考察した。点突然変異誤差はポリメラーゼとして同じ複製速度を持つことを寄生虫を生成した。空間クラスタリングは,誤り率が,重大な誤り閾値以下である限りは,ポリメラーゼの生存を可能にすることを以前に示した。,更にポリメラーゼ早期は鋳型の末端に達し,機能的ポリメラーゼより速く複製されることを短い寄生虫を作る前に複製を停止させるが誤差を考察した。QβRNAはRNAポリメラーゼ蛋白質によって複製されるよく知られた実験では,ウイルスRNAが急速に非常に短い非機能的配列で置換した。ポリメラーゼはリボザイムである場合,同じことが発生したならば,これは終端誤差はRNAワールドを破壊する可能性があることを意味している。本論文では,著者らはこれはここで研究したRNA複製モデルにおける場合ではないことを示した。終端誤差による全ての長さの寄生虫の継続的発生する場合,システムは有限誤差しきい値まで生存し,進行波パターンの形成に起因することができる;,終端誤差は重要であるが,それらは短い寄生虫によるRNAワールドの必然的な破壊を誘導しなかった。最も単純な仮定は,寄生生物複製速度は鎖長に逆比例することである。この最悪のシナリオでは,終端誤差に対する誤差しきい値は点突然変異よりもはるかに低かった。また,鎖の複製のための時間はポリメラーゼの結合のための時間の合計,および重合のための時間がより現実的なモデルを考察した。結合段階を考慮した場合,終端誤差は最悪の場合よりも深刻であった。結合時間が支配的な限界では,複製速度は全ての長さに対して等しく,終端のための誤差しきい値は点突然変異と同じであった。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： RNAポリメラーゼ ,  リボザイム ,  *点突然変異 ,  タンパク質 ,  進行波 ,  誤り率 ,  *複製 ,  寄生生物 ,  *RNA【核酸】 ,  高速度 ,  寄生虫
準シソーラス用語： ウイルスRNA ,  RNAワールド ,  *RNA複製 ,  未成熟 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： RNA世界 ,  ポリメラーゼ ,  Ribozyme ,  誤差しきい値 ,  停止誤差 ,  点突然変異 ,  寄生虫

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： 点突然変異 ,  未成熟 ,  誤差 ,  RNA複製 ,  閾値