ウイルスエンベロープ蛋白質と小児の受容体の間の分子間相互作用を標的とするペプチド配位子の計算機設計【Powered by NICT】

Xu Darong; Bian Hongliang; Cai Jinlan; Bao Daocheng; Jin Qing; Zhu Min; Zhang Cuifeng; Tao Tingting

文献

J-GLOBAL ID：201702270689155090 整理番号：17A1389207

ウイルスエンベロープ蛋白質と小児の受容体の間の分子間相互作用を標的とするペプチド配位子の計算機設計【Powered by NICT】

Computational design of peptide ligands to target the intermolecular interaction between viral envelope protein and pediatric receptor

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資料名：
巻： 69 ページ： 120-125 発行年： 2017年
JST資料番号： H0201B ISSN： 1476-9271 CODEN： COCHDK 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

ウイルスエンベロープ蛋白質小児受容体への認識と結合は,膜輸送装置を破壊する幼児におけるビリオン輸出を仲介する。ここでは,ウイルスのラージエンベロープ蛋白質(LHB)とアダプチン受容体(ADT)間の分子間相互作用を標的とするペプチド配位子の計算設計を述べた。LHBのコア結合部位に相当するオリゴペプチドセグメントと複合体を形成したA DTの結晶構造に基づいて,配列特異的アミノ酸選択プロファイルは構造バイオインフォマティクス法を用いたA DT結合ペプチドを系統的に決定した。プロファイルから採取した情報により,LHBからランダムに生成したペプチド集団の生物学的効力を改善した遺伝的進化法。多くの潜在的ヒットの進化から得られ,四はマイクロモルレベルでA DTと相互作用することを測定した。高親和性ヒットペプチドを計算構造解析に従って最適化した。は強力なペプチドは三領域,すなわちN末端で負に荷電した領域,中間の疎水性コア領域,C末端尾部では小さいが,極性領域に分割できることを明らかにした。添加では,ペプチドの二つの末端はA DTの活性ポケット,ペプチド結合に中程度の寄与をした。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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分子・遺伝情報処理 , 分子構造

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