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J-GLOBAL ID：201702271170744451   整理番号：17A0483928

画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備 第2章 高次解析システムの整備 1 超高速シーケンサーに対応したゲノム断片の整列化機能(1)既存プログラム動作単体試験

著者 (3件)： 伊藤剛 (農業生物資源研) ,  沼寿隆 (農業生物資源研) ,  田中剛 (農業生物資源研)
資料名： 農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果  (農林水産技術会議事務局研究成果)
号： 570  ページ： 12-13  発行年： 2017年03月31日 
JST資料番号： S0070A  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： NGSデータ解析のための有力なプログラムを整備し,実データに適用してデータを検証した。次の開発ステップである結合動作に向けた基盤を整えることができた。(著者抄録)

シソーラス用語： 農作物 ,  *畜産物 ,  遺伝情報 ,  *データベース ,  自動分析計 ,  計算機コード
準シソーラス用語： *農産物 ,  ゲノム情報 ,  次世代シーケンサー ,  解析プログラム

分類 (2件)： システム設計・解析  (IA02030D) ,  ドキュメンテーション  (FA01020I)

引用文献 (10件)：

• Burrows-Wheeler Aligner. http://bio-bwa.sourceforge.net/ (参照日 : 2016.7.11).
• Bowtie: An ultrafast memory-efficient short read aligner. http://bowtie-bio.sourceforge.net/index.shtml (参照日 : 2016.7.11).
• Genome Analysis Toolkit. https://www.broadinstitute.org/gatk/ ( 参照日 : 2016.7.11).
• MegaBLAST. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/html/megablast.html (参照日: 2016.7.11).
• Velvet: Sequence assembler for very short reads. https://www.ebi.ac.uk/~zerbino/velvet/ (参照日 : 2016.7.11).

タイトルに関連する用語 (9件)： 畜産物 ,  ゲノム ,  情報データベース ,  整備 ,  解析システム ,  シーケンサー ,  断片 ,  整列 ,  単体試験