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J-GLOBAL ID：201702272619249949   整理番号：17A0551703

化学シフトに基づいてタンパク質の二次構造を予測するための二次判別分析の利用

Using Quadratic Discriminant Analysis to Predict Protein Secondary Structure Based on Chemical Shifts

著者 (4件)： YUAN Li Z. (Inner Mongolia Agriculture Univ., Hohhot, CHN) ,  E Feng Yong (Inner Mongolia Agriculture Univ., Hohhot, CHN) ,  WEI Zhao (Inner Mongolia Agriculture Univ., Hohhot, CHN) ,  SHAN Kou G. (Inner Mongolia Agriculture Univ., Hohhot, CHN)
資料名： Current Bioinformatics  (Current Bioinformatics)
巻： 12  号： 1  ページ： 52-56  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2353A  ISSN： 1574-8936  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 不明 (ARE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 化学シフトに基づいてタンパク質の二次構造を予測するための新しいモデルについて示した。本モデルでは,化学シフトと二次判別分析法と組み合わせて蛋白質の二次構造を予測した。その結果,10回の交差検証における全体の予測の正確度は85.7%で,αヘリックス,βストランドおよびコイルの正確度は,それぞれ95.2%,83.7%および77.8%であることが分かった。それぞれの核の化学シフトは,タンパク質の二次構造の予測において異なる役割を演じており,特徴としてCC↓α↓C↓β↓H↓α↓Nを用いると,全体の正確さは最大87.3%になることが示された。以上より,本モデルは予測の正確さにおいて他の最先端の方法よりも優れていることが示された。

シソーラス用語： *化学シフト ,  確率分布 ,  統計解析 ,  *交差検証法 ,  タンパク質 ,  二次構造 ,  判別分析 ,  データベース ,  性能評価 ,  精度
準シソーラス用語： *二次判別分析 ,  正確度 ,  *蛋白質二次構造 ,  *統計分布

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (3件)： 化学シフト ,  予測 ,  二次判別分析